个税抵扣中的专项扣除和专项附加扣除，虽然只相差了两个字，但是代表的内容是完全不同的，专项扣除，是按照国家法律法规和国务院政策的规定在税前扣除的专项费用；专项附加扣除，是按照个人所得税法规定，在专项扣除的基础上，按照国务院的规定，在税前扣除的附加费用。
按照《中华人民共和国个人所得税法》第一条的规定，居民个人的综合所得，以每一纳税年度的收入额减除费用六万元以及专项扣除、专项附加扣除和依法确定的其他扣除后的余额，为应纳税所得额。
这里首次提出了专项扣除、专项附加扣除的概念，当然这些概念都是税务部门使用比较多的，专业化程度比较高的概念，对于这些概念的理解，我们主要从内容上来进行区分。专项扣除，主要是指在计算纳税金额之前，扣除了6万元的I费用之后按照国家有关规定，需要在税前扣除的专项费用。
比如按照社保法的规定，社保费用的缴纳是在税前扣除，那么社保费用中基本养老保险、基本医疗保险、失业保险和住房公积金等，就是属于专项扣除，目前机关事业单位工作人员缴纳的的职业年金、企业职工缴纳的企业年金，也是属于专项扣除的费用之一，但今后领取的职业年金、企业年金时就需要按照有关规定纳税。
专项附加扣除，按照个人所得税法例举的内容，主要包括了子女教育费用，职工本人继续教育的费用、大病医疗费用、住房贷款的利息和住房的租金、善养老人的支出等。现在国家提倡一对夫妇生育三个孩子以后，从2022年3月开始，还增加了三岁以下婴幼儿的照护费用等，具体每一项专项附加扣除的费用，各地规定不完全相同，大城市和小城市也有一定的区别。
比如在岗职工的年薪是12万元，首先要扣除6万元的费用，余下的6万元才属于计算个人所得税的纳税金额，在这6万元的费用中，每年要扣除养老保险费用9600元，医疗保险费2400元，失业保险费60元，住房公积金假如缴费比例是12%，扣除住房公积金费用14400元，总计专项扣除26460元，如果所在的企业没有缴纳五险一金的，就意味着没有专项扣除，这26460元就属于应纳税所得额。
然后扣除专项附加费用，赡养父母的费用按照每月1000元来计算，每年扣除12000元，购房或是租房的费用每月1000元，每年扣除12000元，子女教育费也按照每月1000元来计算，每年扣除12000元，这样计算的结果，专项附加扣除每年扣除36000元。
在每年年终汇算或是单位申报时，自己每年的收入是12万元，扣除费用6万元，专项扣除26460元，专项附加扣除36000元，这些项目扣除以后，自己应纳税金额是负数，是负的2460元，就不用缴纳个人所得税。
但如果自己没有专项附加扣除，也就是说自己既不赡养父母，父母有收入来源，没有商品房贷款利息支出、没有住房租金支出，没有继续教育费用或是子女教育费用。那么12万年薪的人，除了扣除6万元费用以外，还要扣除26460元的专项扣除，个人纳税所得金额为33540元，不超过36000元的费率是3%，也就是全年需要纳税1006.2元。
综上所述，专项扣除主要是指社会保险和住房公积金等国家法律法规要依法在税前扣除的费用；专项附加扣除，相当于是专项扣除以后的附加费用，是按照国务院文件规定可以在税前扣除的费用。如果年薪12万元的人，在专项扣除和专项附加扣除以后，基本不用缴纳个人所得税，所以专项扣除和专项附加扣除，在我们在进行个人所得税年终汇算时是非常重要的。
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