为迅速具备新冠病毒型别鉴定能力,确保疾控机构在现场调查和实验检测中能“一锤定音”,进一步提升临沧市新冠肺炎疫情现场处置水平,临沧市疾控中心配备了一套单分子纳米孔基因组测序仪,选派一名业务骨干到省疾控中心进行为期三个月的进修学习,率先完成了设备和人员能力配套建设,并于7月21日首次独立完成了新冠病毒基因组测序实验。
核酸提取
此次实验操作全程均由市疾控中心独立完成,经过数天严谨地实验操作,完成了核酸提取、全基因组捕获扩增、纯化、文库构建等操作步骤,经过基因测序仪数据的运算分析和序列分析比对,检测出实验新冠病毒样本为Omicron BA.2毒株。目前相关数据已按要求上送省疾控中心比对复核。
基因测序仪下机数据的运算分析和序列分析比对
目前,市疾控中心实验室已基本具备独立完成新冠病毒基因组测序分析定型能力,并成为省内首家开展并上报新冠病毒基因序列的州市级实验室。这标志着市疾控中心可以利用单通量测序技术对新冠病毒进行相关基因组测序分析研究,为今后临沧市疫情流调溯源、风险研判与预警、毒株变异研究等方面提供关键技术支撑。
来源:临沧市疾控中心
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