九天雷祖大帝号称雷祖，雷祖是雷部系统的至高神，雷祖之下是雷王，雷王之下是雷神，雷神之下才是诸天雷公，可见雷部组织相当繁杂，因此身为雷部至高神的九天雷祖大帝才得以位列九宸神霄大帝之一。
然而，除了雷祖大帝，还有一人也被称为雷祖，他就是大名鼎鼎的九天应元雷声普化天尊，他也是雷部系统的至高神。
那么问题来了，一个系统怎会有两个一把手？以至于许多人误把雷祖大帝与雷声普化天尊当成了一人。然而他们并非一人，而是品级和神职明显不同的两个人。
根据《天皇至道太清玉册》记载:
九宸，曰长生大帝、青华大帝、普化天尊、雷祖大帝、太乙天帝、洞渊大帝、六波帝君、可韩真君、采访真君，即元始九气化生也，故号九宸上帝。代天以司造化，主宰万物。
由上面这段文字可知，雷祖大帝与普化天尊并为九宸神霄大帝之一，也就是说他们是并列的两个人，并非同一人。
那么二人谁才是真正的雷部一把手，两者又有什么区别呢？
要解开这个问题，就要从两位九宸大帝的住所着手分析。
九天雷祖大帝居住在神霄玉清府，这是雷部以及龙族的最高府衙，他下面设有四府六院三十六司，其中四府包括:九霄玉清府、东极青玄府、
九天应元府
、洞渊玉府。
而九天雷声普化天尊的住所就是
九天应元府
，是神霄玉清府的下设机构之一，由此可知，雷声普化天尊虽然与雷祖大帝并列为九宸大帝，但是二者却是上下级关系，雷祖大帝是普化天尊的上司。
咱们都知道，雷声普化天尊相当于五方五老级别，他的上司至少也是四御级别，那么四御之中谁居住在神霄玉清府呢！那就是被称为万雷之祖的勾陈大帝。
四御之中，紫薇大帝统帅万星，后土娘娘统御万地，长生大帝统御万灵，
而勾陈大帝则协助玉帝统率万雷
。因此勾陈大帝才是雷部的至尊神灵，是雷声普化天尊的顶头上司。
由此可知，
九天雷祖大帝就是勾陈大帝的别称
，勾陈大帝是万雷之祖，是真正的雷部至尊，而雷声普化天尊是负责具体事务的经理人。
二人的关系如同董事长和总经理，九天雷祖大帝(勾陈大帝）挂名董事长，坐镇雷部中枢。而九天应元雷声普化天尊是实际负责人，管理雷部的日常事务。
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