自元一代，西南、华南设立了土司制度，以土官治土民。
这个地方官，某种意义上来说就是一个“土皇帝”，官职世袭，对所管理的土地有世袭所有权，对这片土地上的农民有世袭统治权。
大部分时间内，土司们和中央的关系还是蛮和谐的。这其实就是经济水平和军事力量制衡的结果，那时这些“边远”地区的经济相对差些，人口也没有那么多。不过，经历了一段时间的发展后，有些土司就有想法了，对中央开始抗拒，想自己真正说了算。
不过，在中央实力尚可时，他们还是敛着性子，只敢在自己的辖区内颐气指使，但是，还是有人想试一试。明朝中后期，朝廷已经察觉出了土司的“不服管”，出台了改土归流政策，改土司制度为流官制度。于是，就有人跳出来了，他就是播州土司杨应龙。
流官制度意味着朝廷直接管理地方，等于完全夺去了土司的利益，杨应龙决定叛乱。他敢这么做，是因为他自觉有把握：
一、明朝对西南卫所的建设一直不重视，到了后来，都是直接征用土司军队作战，杨应龙的军队就被征调过数次，这给了杨应龙一个信号：明朝军队已经不能打了；
二、播州境内的军事防御工事修筑完善，俨然就像一个国家；
三、这一点很关键，杨家在播州已有700多年的历史了，极具实力，振臂一呼时，响应很多。
但是，那时的明朝虽然问题多多，不过解决一个地方叛乱还真不算啥难事。万历刚刚在朝鲜战场上完败倭军，直接就将这支部队派去镇压了。十三省兵力一共24万人，114天平息了一场土司叛乱。但是，整个事件贯穿的时间却长达4年。
这场战役影响大么？
用了二百多万两银子，据说，几乎耗光了国库。
调用这么多兵力去西南，等于削弱了东北的防御。国家又没钱，战斗力又下降，会迎来什么结局就是不言而喻之事了。这场土司叛乱其实已经暴露出了明朝的很多顽疾，但是，朝廷并不想放软身段，只想进一步固权，于是，其他土司也有了自立的想法。
历史上的事件绝不会孤独存在。后金的虎视眈眈、农民起义气势如虹，明朝军队疲于应付，四川永宁宣抚使奢崇明看在眼中，心生反心。这时，朝廷募兵援辽，他的女婿樊龙带着人马来到重庆，言之凿凿的说去支援辽东，重庆守城官员哪知这是谎言，于是，开城门迎接，结果被斩了。很快遵义、成都先后沦陷了。
第二年，贵州水西宣慰同知安邦彦也起兵了，奢氏和安氏是互通婚姻，两家就是唇亡齿寒的关系。崇祯二年，奢崇明自称“大梁王”，安延邦则自称“四裔大长老”。朝廷前后用了十七年的时间，才平了“奢安之乱”，影响的省份有贵州、四川、云南、广东等。至于军费呢，光天启六年这一年，就从四百万两增加到了五百万两。
最终，奢崇明兵败被杀，奢家几乎没剩什么人了，其儿子隐姓埋名（余保善）。（大屯土司庄园是余（奢）家十一代苦心经营的建筑物）。至于水西的安氏，虽兵败但实力还在，明朝也没再对安氏强制执行改土归流。直到清朝取代明朝后，安氏才表示臣服。但是，吴三桂入主云南后，下决心要占了水西，为他日后称霸做准备。
于是，吴三桂对水西进行了长达三年的大屠杀，按照地方志的说法，最后只剩下了三十八户水西彝民，他们可是在这块土地上生活了上千年。
朝廷在镇压奢、安之乱时，征用了大量云南土司兵，等于是给他们提供了一个练兵机会。果然，崇祯四年，滇南阿迷州土司普名声叛乱，次年普名声死了，他的妻子万氏继续带着大家和明朝作对。
万氏的做法和普名声不同，一边接受招抚，一边暗地里烧杀抢掠。后来，安南土司沙定洲成了万氏女婿，沙普合流趁着明朝亡国继续作乱。这股势力持续时间长达36年，直到康熙四年，残余势力才被吴三桂完全清除。
这时，西南土司的军事力量几乎殆尽。
崇祯上位后，留给他的就是一个战火不断的国家，这么打仗国库还能有银子么？国家被大小战争拖垮了。等到西南叛乱稍微消停时，明朝已经财力耗尽，国家气数也就尽了。清朝吸取明朝的经验，坚决不搞什么土官治土民，一切都抓在自己的手中，专设云贵总督，有意识加强对边疆的治理，这才强化了国家的统一状态。
参考资料：
【《景泰云南图经志书》、《蛮司合志》】
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