DNA编码化合物库技术的学习和追踪“神器”——DELFinder的实际应用案例

导读

近日，Scott E. Wolkenberg博士团队利用药明康德HitS事业部自主开发并运维的DELFinder搜索引擎和DELopen平台，顺利完成DEL相关领域论文的检索工作，并成功在《ACS Medicinal Chemistry Letters》杂志上发表论文（论文链接在文末）。

Wolkenberg团队发表的文章

DEL技术和相关文献搜索引擎

近年来兴起的DNA编码化合物库（DNA-Encoded Library）技术，基于独特的组合化学原理，将小分子化合物和DNA标签相结合，受到越来越多学术界和工业界药物研发人员的关注与青睐，在新药发现领域发挥着越来越重要的作用。

DEL技术原理

由于DEL技术是化学、生物学、信息学的多学科跨界创新产物，通过主流数据库来检索相关文献，会遇到很多的干扰信息，想找有用的资料来了解和学习DEL技术困难重重。

2020年1月3日，DELopen团队自主开发并上线了一款专用于DEL领域的学术搜索引擎——DELFinder，免费为全球研发人员提供关于DEL技术的数据信息检索服务。

DELFinder : https://delopen.org/scripts

DELFinder搜索引擎首页

论文简介

近日，Scott E. Wolkenberg博士团队使用DELFinder工具，完成DEL相关论文的检索工作，并在ACS Medicinal Chemistry Letters杂志上发表了综述性文章《Trends in Hit-to-Lead Optimization Following DNA-Encoded Library Screens》[1]。

该篇综述首先对DEL筛选和传统的HTS（High Throughput Screening，高通量）筛选进行简要概述和对比，同时检索并筛选大量已发表的DEL筛选和HTS筛选相关文献，通过归纳和分析大量文献数据，类比了由DEL筛选或HTS筛选获得的苗头化合物以及后续的先导化合物优化的流程和效果，具体分析了包括BRD4、DDR1和BETm等靶点的优化案例。

Wolkenberg团队综述的主要内容

值得注意的是，该篇综述同时使用了SciFinder和DELFinder进行文献检索和收集。其中，2016-2020年间的DEL技术相关文献均来自于DELFinder的检索结果。

综述使用了SciFinder和DELFinder检索工具

在杨森（Janssen）公司研发部工作的Wolkenberg博士高度认可由药明康德HitS事业部开发并运维的DELFinder搜索引擎和DELopen平台，并评论道：“DELopen平台的资源非常棒，衷心感谢药明康德团队为此做出的努力和贡献。”

“DELopen is a great resource and we appreciate the effort made by the WuXi AppTec team to build and maintain it.”

——Scott E. Wolkenberg

DELFinder

由DELopen团队开发的学术搜索引擎——DELFinder，致力于为全球研发人员提供所有关于DEL技术的数据信息检索服务[2]。（点击下图，获得关于DELFinder 的详细介绍。）

DELFinder收录了公开报道的与DEL相关的所有文献、专利、书籍、博士论文、会议论文、行业新闻、临床报告等数据信息。研发人员可以通过筛选条件，如文献类型、企业/学术机构、发表日期、数据库来源等，或者输入关键字，快速、精准地检索到想要的DEL相关文献或报道，通过提供的原文链接获得相关信息，从而学习和追踪DEL技术的研究进展和最新应用。

为满足全球科研用户的需求，DELFinder不断升级迭代。

最新版DELFinder 2.0的检索界面：不仅会显示文章信息，该文献相关的DEL Library，DEL Hit及DNA Compatible Chemistry也会被明确列在检索到的文献页，并配以简明图示，辅助用户快速理解文章。真正做到不用登录，无需阅读原文，即可轻松掌握每篇文献的关键信息，大大缩短了精准检索所需文献的时间[3]。此外，DELFinder 2.0中的推荐指数也为用户筛选全球最前沿最优质的DEL科研成果提供了便利。（点击下图，获得关于DELFinder 2.0的详细介绍。）

DELFinder 2.0使用界面

DELopen

DELopen平台是药明康德HitS事业部基于合作、赋能、创新等理念，联合医药研发领域顶级学术研究机构共同发起的、致力于推动DEL技术应用和开发的开放式新药研发合作平台。（点击下图，获得更多关于DELopen的信息。）

DELopen平台的突出特点是其公益性和互动性。它面向的是全球所有高校、研究所和非盈利组织等学术机构，科学家们可以通过DELopen平台与工业界合作，利用DEL技术高效地完成早期药物发现，协作推动全球生物制药领域科学和技术的发展，最终造福广大病患。

而依托DELopen平台的“DELopen新药筛选包”，是药明康德HitS事业部于2018年12月推出的自助式DEL筛选试剂盒，现已服务全球百余家学术机构，多个机构已经成功找到相关靶点的苗头化合物（Hit），并成功开启后续的药物研发工作。药明康德“DELopen新药筛选包”项目荣获第五届 “社会价值共创”优秀奖[4]。

参考文献

[1] https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acsmedchemlett.0c00615

[2] DEL技术的学习和追踪“神器”——DELFinder上线啦！

[3] 不用登陆，速览DNA编码化合物库技术文献——全新DEL数据在线检索系统（DELFinder 2.0）上线啦！

[4] 药明康德“DELopen新药筛选包”项目获得第五届 “社会价值共创”优秀奖

关于药明康德 HitS事业部

药明康德HitS事业部为全球药物研发行业提供具有竞争力的一体化靶标到苗头化合物发现解决方案。本着以研究为首任，以客户为中心的宗旨，药明康德HitS事业部通过高质量和个性化的研发服务，助力客户提升先导化合物开发效率，服务范围涵盖蛋白科学、基因编码化合物技术、片段小分子筛选、生物物理学研究、结构生物学研究等领域。

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