《特赦1959》里，功德林的国军高级将领们讨论解放战争中国军指挥得失的问题时，尤其是山东战场的失败，王耀武、李仙洲、叶立三等人都指责陈诚在山东的瞎指挥，导致山东战场的国军频频失败，损兵折将，将国军在山东的优势转变成了被动局面，导致莱芜战役大败。就在大家都在指责陈诚瞎指挥的时候，黄维在旁边冷冷的说了一句，难道何应钦就没有责任吗？
从这里就可以看出，何应钦和陈诚在国军中的地位。就是说，在国军被俘高级将领心目中，他们这些人都不过是受人驱使的鹰犬而已，真正有资格对国军在解放战争中的全面失败负责任的，不是他们这些人，而是陈诚、何应钦这些大佬级别的人。功德林被俘的高级将领分不同的派系，每个派系都有人被解放军俘虏，所以争吵起来的时候，就会相互指责。比如杜聿明是何应钦派系，黄维、杨伯涛是陈诚一系。
用李宗仁的话说，何应钦和陈诚一样，都是蒋先生的“夹袋中人”，能力平庸，但深受蒋的信任，属于蒋用起来比较顺手的那种人，听话，好用，召之即来，来则能用。所以，蒋在军事方面经常是陈诚和何应钦两个人轮换着用，用一段陈诚，出了问题，就改用何应钦，何应钦出了问题，又改用陈诚。相比于何应钦，陈诚虽然能力有限，但是忠心无限，蒋更为信任。
不过，何应钦也不是一个人在战斗，虽然他的派系势力远不如陈诚的土木系那么庞大，但是势力也不小，很多人也是靠他在中枢照顾，才能为党国奔走，效命疆场。比如杜聿明，就非常明确的说，他在中央的关系，全靠何应钦。陈诚上来了，他就靠边站，陈诚下去了，何应钦上来了，他就又能出来指挥部队了，受到重用。解放战争初期，杜聿明在东北连战皆捷，后来受挫，国军统帅部改用陈诚取代杜聿明，陈诚在东北连吃败仗，连电请辞，何应钦就又出来了。基本上是陈诚与何应钦的二人转。
北伐和抗战时期，何应钦都是中央军当仁不让的二把手，不过1930年以后，陈诚的地位就上升得很快，但这时候陈诚还没有资格和何应钦相抗衡，资格和势力都还小了些。到抗战时期，陈诚的地位不断提高，在一些重要的关键时刻，陈诚实际上都是蒋的化身和代表。比如1941年宜昌失守之后，西南大震，关键时刻，陈诚就被任命为第六战区司令长官，从第五战区中划出了一部分，由陈诚负责保卫重庆外围，这样蒋才能放心一些。
何应钦在北伐时期是蒋最信任的高级将领，随着陈诚的地位上升，蒋对他的信任开始有些减弱，但还不明显。到西安事变的时候，国军群龙无首的局面下，何应钦一度成为中央军的中心，这时候他明知中央军强攻可能导致张杨撕票，他却还是下令空军轰炸，并组织了讨伐张杨的司令部，准备武力进攻，欲置蒋于死地。也是因此，西安事变过后，蒋对何应钦的态度大变，成了既用又防，既疑又用。但相比白崇禧等人，蒋当然还是更愿意相信何应钦。
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