“艾”学习丨样本DNA提取系列

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泥萌周五好呀

小艾又来啦

今天推荐艾学习的主题是

样本DNA提取系列

1.如何提取生物膜中DNA？

生物膜也称为生物被膜，是指附着于有生命或无生命物体表面被细菌胞外大分子包裹的有组织的细菌群体。生物膜细菌对抗生素和宿主免疫防御机制的抗性很强。生物膜中存在各种主要的生物大分子如蛋白质、多糖、DNA、RNA、肽聚糖、脂和磷脂等物质。生物膜多细胞结构的形成是一个动态过程，包括细菌起始粘附、生物膜发展和成熟扩散等阶段。

小艾这边推荐Norgen Biotek的生物膜DNA提取试剂盒（cat# 62300--50次分析），用于从生物膜快速制备基因组DNA。

优势：1. 从不同类型的生物膜中分离基因组DNA的快速便捷方法；2. 无需苯酚或氯仿萃取；3. 产生可用于PCR和其他下游应用的高质量DNA。

2.如何提取真菌/酵母基因组DNA？

真菌是一种产孢子的、无叶绿体的真核生物。包含霉菌、酵母、块菌以及其他人类所熟知的菌菇类。目前已经发现了十二万多种真菌。真菌独立于动物、植物和其他真核生物，自成一界。真菌的细胞有含甲壳素, 能通过无性繁殖和有性繁殖的方式产生孢子。

小艾这边推荐Norgen Biotek的真菌/酵母基因组DNA提纯试剂盒（cat# 27300--50次分析，27350--96孔板形式，高通量提取）。

优势：1. 快速纯化活酵母细胞，真菌孢子或菌丝体以及细菌（包括革兰氏阳性）中的基因组DNA；2. Beads管（已提供）可实现有效的机械均质化；3. 纯化的DNA具有高品质和完整性，并与任何敏感的下游应用（如PCR，qPCR，测序等）兼容。

3.如何提取噬菌体中DNA？

噬菌体（phage）是感染细菌、真菌、藻类、放线菌或螺旋体等微生物的病毒的总称，因部分能引起宿主菌的裂解，故称为噬菌体。噬菌体是病毒的一种，其特别之处是专以细菌为宿主。噬菌体具有病毒的一些特性：个体微小，不具有完整细胞结构，只含有单一核酸。与其他病毒一样，噬菌体必须感染宿主细胞才能繁殖。构成感染过程的步骤统称为噬菌体的生命周期。

小艾这边推荐Norgen Biotek的噬菌体DNA提纯试剂盒（cat# 46800--50次分析，46850--100次分析）。提供了一种快速柱提法，用于从液体培养物中生长的细菌中繁殖的广谱噬菌体中纯化总DNA。纯化的总噬菌体DNA具有最高的完整性，可用于许多下游应用，包括PCR，qPCR，限制性片段长度多态性（RFLP），测序，克隆，Southern印迹等。

优势：1. 从多种噬菌体菌株中分离出高质量的DNA；2. 总DNA产量高；3. 使用柱提法快速简便地处理，在不到45分钟的时间内完成；4. 不需要苯酚或氯仿萃取或氯化铯结合条带；5. 从106-1010pfu/mL的富集噬菌体中回收3-15μg高产量的DNA。

4.如何提取食物中DNA？

小艾这边推荐Norgen Biotek的食物DNA提纯试剂盒（cat# 54500--50次分析）。用于从多种动物或植物来源的食品样品中分离和纯化总DNA。该试剂盒用于鉴定食品和饲料中的GMO-DNA或动物成分，可用于多种原材料，包括生或加工食品，肉，酱料和乳制品如牛奶，奶酪和酸奶等。

优势：1. 从多种食品中分离DNA（如煮沸的，流动的，加工的或未加工的食品）；2. 不需要有害化学物质（如苯酚或氯仿）；3. 蛋白酶K和可选的溶菌酶处理以有效裂解；4. 快速离心柱的便捷处理；5. 与多种食品的GMO-DNA分离具有广泛的兼容性；6. 食品相关病原体DNA提取的通用操作（革兰氏阳性和革兰氏阴性）；7. 纯化的DNA具有高完整性，可用于许多下游应用，包括基于PCR的检测，测序和基因分型。

5.如何提取牛奶中的细菌DNA？

小艾这边推荐Norgen Biotek的牛奶细菌DNA提纯试剂盒（cat# 21550--50次分析）。用于从牛奶样品中的革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌中分离和纯化基因组DNA。

优势：1. 试剂盒具有很高的敏感性，在1mL牛奶中可以从多达10个细菌细胞中分离出基因组DNA；2. 从牛奶中革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌中分离基因组DNA；3. 可以处理挑战性的样品，例如乳脂牛奶；4. 无抑制剂的DNA可用于PCR，qPCR，Southern印迹，测序等；5. 快速高效的旋转柱格式。

6.如何提取橄榄油中DNA？

小艾这边推荐Norgen Biotek的橄榄油DNA提纯试剂盒（cat# 61700--50次分析）。用于从橄榄油中快速制备基因组DNA，以便通过验证油的真实性来支持遗传可追溯性，从而防止掺假。还可用于从其他加工油（例如低芥酸菜子油，葵花籽油或植物油）中纯化DNA，以便进行下游分析和掺假油测试。通过热处理，均质化和独特的裂解缓冲液的组合，可从0.5 mL油中有效提取基因组DNA。

优势：1. 使用快速旋转柱格式快速轻松地处理；2. 在不影响总产量的情况下分离总DNA；3. 无需苯酚或氯仿萃取；4. 从各种油样中分离出高质量的总DNA。

7.如何提取土壤中DNA？

土壤是有机物质，矿物质，气体，液体和生物体的混合物，它们共同维持生命。地球的土壤，称为土壤圈，有四个重要的功能：作为植物生长的媒介；作为储水，供水和净化的手段；作为地球大气层的修饰者；作为生物的栖息地。土壤有机质由有机化合物组成，包括生物和死亡的植物，动物和微生物物质。典型的土壤具有70％微生物，22％大型动物和8％根的生物质组成。土壤资源对环境的影响至关重要。

小艾这边推荐Norgen Biotek的土壤DNA提纯试剂盒（cat# 64000--50次分析，64060--100次分析，26560--96孔板形式，58100--磁珠系统--50次分析，62800--磁珠系统--96孔板形式）。

优势：1. 快速便捷的土壤样品中微生物检测方法；2. 处理所有土壤类型；3. 使用OSR溶液去除有机物质；4. 去除DNA样品中的所有腐殖酸；5. 使用快速旋转柱格式快速轻松地处理；6. 从细菌，真菌和藻类等多种微生物中分离出高质量的总DNA。