动漫“CLANNAD”是根据steam上同名游戏“CLANNAD”改编而来，所以动漫“CLANNAD”存在多条女主线，多条故事线以及多种结局。
在古河渚很小的时候，发生了一次意外，古河渚因此发了高烧并且无法治愈。绝望的古河秋生把渚带到小镇的一片土地上，这时，渚的身边被“光”所包围，奇迹般地活了下来。从此，渚的生命就和小镇的土地紧紧相连了。但好景不长，这片土地将要建一所大医院，树木全部被砍倒，渚的生命因小镇的开发而继续衰弱下去。古河渚在分娩冈崎汐的时候，身体更加虚弱，古河渚因此去世。
古河渚生下冈崎汐后耗尽了生命，新生的冈崎汐继承了古河渚与小镇联系着的灵魂。因为汐的生命与小镇联系着，汐同样发了高烧并且无法治愈，最后汐倒在一片雪地中。这些是同名游戏“CLANNAD”一周目的结局。
在三周目中，冈崎汐在一周目去世后来到了“幻想世界”作为众多“光”的守护者而存在，冈崎汐（少女的形象）带着冈崎朋也（机器人的形象）想要离开“幻想世界”去拯救古河渚。他们通过各种方法都无法离开“幻想世界”，最后通过“传承的思念”，冈崎朋也来到现实世界中与渚最初相遇的时间点并且失去了“幻想世界”的记忆。
冈崎朋也在失去渚后很自责，认为如果当初不与渚相遇或许就不会发生这样的事，渚鼓励着朋也，希望他不要再迷惘，不要后悔两人的相遇，两人就如同第一次见面一样，一同踏上了樱花树下的坡道。冈崎朋也通过与诸多女性角色之间的经历收集“光玉”，最终成功收集了13颗“光玉”，“幻想世界”中的冈崎汐的灵魂和意志回归到当年古河秋生为渚祈祷的大树下，与现实中新生的汐合并。
最终，小镇的居民们恢复了和谐友爱的关系，同时热爱并保护着小镇，小镇因此而繁荣，幻想世界从中获得了足够的力量，不再需要渚和汐作为代理者提供养分。当时间再次来到渚分娩时，渚避免了死亡，一家人由此团聚，从此幸福地生活下去，也带动着整个小镇的幸福。——TURE END
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