公元1673年，康熙皇帝在位的第12年，盘踞西南地区的平西王吴三桂发动了叛乱。随后，耿精忠和尚可喜也先后叛乱，这就是历史上著名的三藩之乱。吴三桂在鼎盛时期，控制了云南、贵州、广西、四川、湖南等大片地区，总兵力达到了30万。但是在与清朝军队的作战中，清朝军队往往能够以少胜多。那么，吴三桂军队的整体战斗力，为何不如清朝军队呢？
首先，我们聊聊吴三桂的军队。在平定了南明永历政权以后，由于南方的形势仍不稳定，清朝命令平西王吴三桂坐镇云南，节制云南、贵州的军民。但清朝方面对吴三桂并不放心，康熙2年，清朝中央收回了平西大将军印。康熙6年，又收回了吴三桂的西选官特权。在此之前，吴三桂有权力任免云南、贵州两省的各级官员，而且还能推荐亲信在其他省份任职。例如四川省、广西省、陕西省等地，都有吴三桂的亲信。朝廷以“截其用人题补之权，迁除悉归部选”的理由，收回了吴三桂的西选官特权。解除了吴三桂的人事任免权以后，朝廷又开始削弱吴三桂的军事指挥权。
吴三桂原来有6万军队，天下稳定以后，清朝要求吴三桂裁军，而且幅度非常大。在名义上，吴三桂只剩下了24000人。即便是自己暗中维持了一万多军队，吴三桂军队的总数也只有4万左右。年轻的康熙皇帝处理完内部事务以后，开始对三藩动手了。公元1673年，三藩之一的尚可喜请求告老还乡，这本来是三藩以退为进的策略。但是没有想到，康熙皇帝直接同意了尚可喜的请求，并且撤销了另外两个藩王。认真的说，三藩没有料到康熙皇帝敢撤藩，康熙皇帝没有料到三藩敢造反。因此，康熙皇帝下达了撤藩的命令以后，一边是匆忙造反，另一边是匆忙迎战。
吴三桂造反以后，开始迅速扩充兵力，抓了很多壮丁入伍。其实，除了那4万旧部以外，其他新组建的部队根本没有多少战斗力。由于清朝方面根本没有准备，吴三桂造反以后，清朝方面猝不及防。除了自身本来就控制的云南和贵州，吴三桂迅速占领了四川、广西、湖南等地。但是在占领湖南以后，吴三桂不再继续进攻。首先，自己的战线拉的太长，后勤补给已经到达了极限。第二，吴三桂甚至还幻想着康熙皇帝的招安，并且找了一些清朝高官。第三，过了长江以后，即将进入平原地区。吴三桂的军队以轻装步兵为主，与清朝骑兵作战，基本没有什么优势。更何况，吴三桂所能依靠的只有那几万老部队。
吴三桂发动叛乱以后，清朝方面确实陷入了慌乱。但经过一段时间以后，清朝最高层从慌乱中反应了过来，康熙皇帝开始调动部队围堵吴三桂。在岳州大战中，清朝军队以少胜多，吴三桂开始转攻为守，战略局势开始逆转。吴三桂的军队基本上沿用了明朝时期的战术、战法，这本身没有问题。但是面对清朝骑兵，则出现了一系列的问题。其实，镇压吴三桂叛乱的清朝军队中，大部分都是绿营军，而不是当年的八旗军。除了打击吴三桂本部以外，清朝还非常注意拉拢吴三桂手下的部将，例如坐镇陕西的王辅臣。王辅臣拥有8万军队，几乎能够左右战局的发展。
由于仓促造反，吴三桂在各方面的准备都不充足。清朝掌握主动权以后，吴三桂开始节节败退。吴三桂为了鼓舞士气，选择了称帝，这直接背弃了自己“兴明讨虏”的口号。不过，吴三桂造反没有起到什么效果。吴三桂去世以后，吴三桂的孙子继续与清朝对抗，但大势已去。清朝军队逐步攻入云南境内，最终平定了这次叛乱。在平定三藩叛乱中，清朝八旗军的战斗力已经出现了明显的下降，连吴三桂都感觉“当年，大清的虎狼之师都去哪了？”由于八旗军的战斗力下降，原本用于辅助的绿营军的地位开始逐步提高。到了雍正、乾隆时期，绿营军成为了作战的主力。
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