从人事任命以及权利层级角度而言，欧盟理事会要高于欧盟委员会。但是需要注意的是，由于欧盟理事会的重要作用，它并没有所谓的理事长——并不是由某个理事长主导欧盟理事会工作。欧盟理事会实行轮值主席国制，由各个欧盟成员国轮流担任理事会主席。
也就是说，欧盟理事会的理事长并不是个人，而是整个国家（一般由该国的外交部长代表国家、主持欧盟理事会工作）。即便如此，在具体的事务中，欧盟理事会也并不能简单地被某个国家主导，而是由当值主席国、下一任主席国以及秘书长三方共同决定。
欧盟理事会秘书长由全体欧盟成员国共同推选决定。
@ 欧盟理事会、也被成为欧盟部长级会议（主要由各国外交部长负责）
相较而言，欧盟委员会的组织工作就简单和单纯一些——由某个委员会主席主导所有的欧盟事务。从双方领导层构成的复杂程度的差异来说，欧盟理事会就要比欧盟委员会重要的多。
欧盟理事会领导层的权力分布更加复杂，而委员会就简单很多。
@ 现任欧盟委员会主席让-克洛德·容克
从职责上讲
欧盟委员会又被成为欧盟执委会，主要负责起草适用整个欧盟的欧盟法律，被称为整个欧盟的发动机。和其他的国家和地区不同，欧盟没有政治权利、没有自己的领土，因此起对于整个欧盟来说，起草法令具有重要意义。
从实际意义上讲，起草法令就是欧盟的主要全部工作，欧盟也正是通过一个个法令整合欧洲、推进欧洲一体化。
@ 象征着欧盟全部的欧盟委员会
但是需要注意的是！
首先，从人事任命的角度来说，欧盟委员会主席的任命需要得到欧盟理事会的认可。从这个意义上来说，欧盟委员会属于欧盟理事会的“下级机构”。
其次，欧盟委员会的工作看起来非常重要，也非常非常关键。但是，欧盟委员会并没有起草法令的自由！从双方的互动来看，欧盟理事会决定起草什么样的法令，之后欧盟委员会商讨相应的细节、拿出具体的法律法规。
说的直白一些，欧盟理事会中的各国部长聚在一起，讨论各国可以共同推行什么样的欧盟法令，最后根据各国部长的讨论结果，通知欧盟委员会拟定具体的法律条文。
因此，确实是欧盟理事会权利更大，它才是欧盟的真正中心、是整个欧盟真正的首脑。
注：欧盟有四个分支机构：欧洲理事会、欧盟理事会、欧盟委员会、欧盟议会。
其中，欧洲理事会由各国首脑组成，是权利意义上的欧盟领袖。但是，各国首脑非常忙碌，大家不可能天天聚在一起开会、决定欧盟事务。
因此，在实际事务中联系各国、共同商讨欧盟大大小小事务的，是由各国外长组成的欧盟理事会。
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