苏联海军的地位次于陆军，其重要性与陆军相比是微乎其微的。当斯大林预感到德国将在次发动大战之时，苏联首先优先保证陆军和空军的要求，因此在1935年之后的苏联海军一直没有多大进展。当时间来到1941年时，整个苏联拥有三艘战列舰、七艘巡洋舰、五十九艘驱逐舰、二百六十九艘鱼雷艇和二百一十八艘潜艇以及大批布雷舰、扫雷舰和辅助舰。在数量上已经超过了德国海军，但是在二战海战史中则鲜有苏联海军的身影，这是为什么呢？
战争爆发之苏联海军下辖四个相互远离的舰队。最大的三个舰队是：以塔林为基地的波罗的海舰队、以塞瓦斯托波尔为基地的黑海舰队以及以符拉迪沃斯托克为基地的太平洋舰队。第四个舰队是以不冻港摩尔曼斯克为基地的北方舰队，它比另外三个舰队规模小得多。
1941年6月，北方舰队只拥有八艘驱逐舰、十五艘潜艇和不到二十艘的其他小型舰艇，另有一百多架飞机进行支援，舰队总司令为戈洛夫科。当时为了应对德国，又从太平洋舰队调来五艘潜艇。当苏德战争爆发后，德国的战略是立足于通过芬兰领土上发起的地面进攻，占领摩尔曼斯克和切断摩尔曼斯克铁路的。因此在这个区域主要为陆战，北方舰队仅仅用来支援苏联陆军作战，很少出海与德国海军作战。
同时在1942年开始，摩尔曼斯克成了进口英美援助物资的重要港口，而少量的北方舰队为了防止运输线被切断，仅仅活动于港口周围的海域，不敢出海与训练精良的德国海军作战，尤其是惧怕被德国的潜艇击沉。
第二个就是波罗的海舰队。波罗的海舰队原先的基地在喀琅施塔得，但在1940年向前移至塔林，喀琅施塔得便留作后方支援基地。波罗的海舰队由特里布茨指挥，拥有两艘战列舰、两艘巡洋舰、四十艘驱逐舰、六艘鱼雷艇、一百多艘鱼雷快艇以及九十三艘潜艇。
苏德战争爆发之后，由于德国空军和陆军取得的成功，让苏联位于波罗的海周边的海军基地尽数丢失，因此苏联海军遭到严重的打击。苏联海军被迫退守喀琅施塔得和列宁格勒。1941年冬天到来芬兰湾结冰，苏联的波罗的海舰队被困于喀琅施塔得和列宁格勒。
1942年4月，芬兰湾解冻后，6月苏联海军计划进入了开阔的波罗的海水域，可是由于人员训练和装备都不理想，对德国海军作战效果不理想，而且不少苏联舰艇被德国海军击沉，因此苏联的波罗的海舰队不得不再次龟缩在喀琅施塔得和列宁格勒。直到1944年苏联陆上的反攻开始，才开始配合苏联陆军陆续收复了波罗的海沿岸基地。
苏德战争爆发之后，苏联黑海舰队总指挥是奥克佳布尔斯基，舰队内有一艘老式战列舰、五艘巡洋舰、十五艘驱逐舰，五十艘的潜艇，以及为数众多的鱼雷快艇和轻型舰艇。开战之初，因为黑海内仅有罗马尼亚有部分舰艇，所以黑海舰队主动出击，轰击德国和罗马尼亚在黑海沿岸的阵地和设施，同时还袭击了敌人海上的运输船只。
但是在1942年，苏联丢失了塞瓦斯托波尔海军基地，黑海舰队只好撤往高加索的巴统等沿岸城市。而德国则将生产出来的部分袖珍潜艇，利用多瑙河到达黑海并进驻塞瓦斯托波尔。而到1943年，德国在黑海地区拥有了二十三艘扫雷艇、十六艘鱼雷快艇、五十艘登陆艇和二十六艘猎潜艇。此后苏联黑海舰队就以没有空中掩护以由，拒绝出海与德国海军作战，只到苏联陆军收复克里木半岛之后，黑海舰队才回到塞瓦斯托波尔。
第四就是苏联的太平洋舰队。但是世界大战的东方战场主要是中国战场与太平洋战场，海战也是美日之间的较量，这之间的主因就是日本在北上还是南下的策略中，在诺门坎被苏联轻松击败，苏日之间签订了和平条约。所以太平洋舰队也就没有作战的需要了。
但是谈到第二次世界大战中苏联海军时，不少人认为苏联海军之所以龟缩不战，主要是因为斯大林可能想保存他的军舰以便到战后能对英美海军的优势进行挑战。但是实际上还有诸多原因让苏联海军不能出海作战，诸如苏联海军指挥员缺乏进攻精神、苏联舰队的制造技术不如德军、苏联海军的战术水平仍然停留在一战的水平。诸多的原因让二战史中鲜有苏联海军表现的高光时刻。
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