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中华花龟背甲长 20厘米 ，宽 16厘米 。中华花龟头部、颈部及四肢的皮肤上都长著亮绿色和黑色的条纹，龟头部较小，顶后部光滑无鳞，上喙有细齿，中央部有凹陷。幼体背甲呈浅灰绿色，有三条明显的脊棱。
成年背甲会变为偏向棕色，背甲上的其中两条脊棱会渐渐消失。腹甲棕黄色，每一盾片具有一块大墨渍状斑块，腹甲后缘缺刻。甲桥明显，背甲腹甲间借骨缝相连。中华花背甲呈粟色且略拱，后缘不呈锯齿状。
体型小的幼年龟(个体重250克以下)因性未成熟，性别难以鉴定。某些JS在出售幼年巴西龟时，说可以根据腹甲花纹来判断性别，这完全没有科学根据。同年龄的龟，雌性个体体形总是大于雄性个体。
雌龟较大，泄殖腔孔位于背甲后部边缘内;雄龟较小，背甲色较黑，尾部粗且长，泄殖腔孔位于背甲后部边缘外。
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