不知何时起，有益菌这个词逐渐进入公众视野，有益菌和有害菌的菌落平衡也逐渐被很多人重视起来，但是大多数人提起菌落就联想到肠道的菌落，但事实上，菌落的分布远不止肠道，我们的皮肤、呼吸道、口腔同样分布着大量的细菌。
以呼吸道为例，我们的呼吸道中分布了大量的细菌，这些细菌正常情况下会维持一个平衡，但是当有害菌打破了这个平衡后，开始泛滥了，这时候就会造成上呼吸道感染。
人在出生后，鼻咽部的菌群就发生了变化，新生儿最初鼻咽部主要分布的细菌是是莫拉菌属、棒状杆菌属、狡诈菌属、链球菌或葡萄球菌属。此后，随着饮食以及各种环境影响，各种细菌的比例也会发生变化。纯母乳喂养的婴儿在出生 6周后放线菌明显增加; 而纯配方奶喂养的婴儿则表现出金黄色葡萄球菌为优势菌，而菌群中的流感嗜血杆菌与儿童早期呼吸道感染和喘息的发生有关。
成人鼻咽部菌群，除了没有莫拉菌属外，菌群成员基本与儿童一样，但是不像儿童有明确的菌群模式。成人和老年人口咽菌群具有高度多样性的。幼儿鼻咽有少量同鼻和口腔菌群一样的革兰阴性厌氧菌，如普雷沃菌属和韦荣球菌属，这可能是幼儿口腔物经常反流到鼻腔造成的。
我们常说的咽炎，就是因为某些有害菌占据优势导致的，这些有害菌主要是A族β-溶血性链球菌（化脓性链球菌）、B族β-溶血性链球菌（无乳链球菌）、停乳链球菌亚种、假单胞菌属和莫拉克斯菌属。
我们注意到很多孩子感冒后，使用抗生素治疗，但是从此就特别容易出现上呼吸道感染，就连过敏性疾病也更容易发生，例如，孩子在1周岁以内使用抗生素，日后患哮喘的风险会提高1.13倍。如果超过4次，患哮喘的风险会提高2.32倍。这就是因为抗生素破坏了呼吸道的正常菌群失衡
打一个比方，一个城市被敌人进攻了，敌方占据了上风，你直接丢一颗导弹，把整个城市都炸了，之后，是我方占据上风，还是敌方占据上风？那就不一定了。如果是病毒引起的感染，那就更没有使用抗生素的必要了，所以，使用抗生素药谨慎、再谨慎！
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