外蒙古即今天的“蒙古人民共和国”，这里原本是清朝乌里雅苏台将军的管辖地域，曾属于中国。从清朝雍正年间开始，在当地设置了“乌里雅苏台将军”衙门，之后作为固定官职保留下来。1912年清朝灭亡后，外蒙古在沙俄政府（包括后来的苏俄）的支持下宣布脱离中国。
外蒙古的起源可以追溯到明末清初的漠北蒙古诸部。在明朝末年时，蒙古的主体分裂为漠南、漠北、漠西三大蒙古，其中漠南蒙古察哈尔部的林丹汗是黄金家族的直系后裔，但是很快被清太宗皇太极所灭。 在清朝入关前，漠北蒙古各部已经开始对清朝称臣，并保持“一年一贡”的规矩，他们就是今天外蒙古（蒙古人民共和国）的祖先，又称为“喀尔喀蒙古”（漠北蒙古）。
公元1688年，喀尔喀蒙古被准嘎尔部（漠西蒙古）所逼，投奔于清朝。在清康熙三十年（1691年）举行的多伦诺尔会盟中，漠北蒙古宣誓归附于大清。直到这个时候，清朝才真正开始统治外蒙古地区。
清朝全盛时期只在传统的汉地设置省份，而在边远地区实行将军管理（清朝设置了14位地方将军）的制度。东北三省分别由黑龙江将军、盛京将军、吉林将军管辖；天山南北（新疆局部）由伊犁将军管辖；外蒙古与唐努乌梁海等地区则由乌里雅苏台将军管辖。
遗憾的是辛亥革命过后，外蒙古在沙俄的支持下宣布独立，并遣送乌里雅苏台将军回国，造成独立事实。北洋的将领徐树铮曾经趁沙俄十月革命的机会短暂收复过外蒙，但不久后新兴的苏联又使用手段使外蒙古独立。对此，北洋政府与后来的国民政府均表示无能为力，只进行过口头谴责。1924年，外蒙古正式成为蒙古人民共和国，并奉行亲苏亲俄路线。
其实从1921年开始，苏联当局就在外蒙古大肆烧毁庙宇、逮捕僧人，摧毁了藏传佛教，逼迫蒙古人信奉东正教。1932年，斯大林为了镇压蒙古反抗行动，在外蒙古进行血腥清洗，造成数万人死亡。苏联对蒙古的剥削、屠杀往往被“苏联红军与对蒙古现代化的帮助”这样的官宣话轻描淡写、一撇带过，容易让人忽略。在苏俄的洗脑下，外蒙古（蒙古国）废除了传统的蒙文，改用俄罗斯的斯拉夫字母书写文字，还有不少外蒙古人放弃了藏传佛教，转而信奉基督或东正。
新中国成立后，为免历史遗留原因引发两国争议，客观上承认了蒙古人民共和国的地位。不过蒙古国在上世纪始终亲近苏联而疏远我国。在历史归属上，蒙古国极力淡化过去属于清朝的历史，并不承认自己属于中国。在现代蒙古国的主流舆论中，长期指责清王朝（中国）对他们进行了奴役和屠杀，并对华人甚至是中国商人带有抵触和仇视心里。事实上，这正是沙俄、苏联、俄罗斯长达70年来对蒙古国进行文化洗脑的结果。
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