清制，一县的最高行政长官为知县。除此之外，下面还设有县丞、主簿等事职及典史等事务性官员。
1、县丞：按制县丞为正八品官（京县除外）。县丞的来源有贡生及会同馆大使、鸿胪寺鸣赞、序班、刑部司狱、汉军九品笔帖式、布政司照磨、盐运司知事、按察司照磨、府知事、县主簿、府州县训导、府照磨、通判等。县丞任满后如考绩优异予以升任的话，可以升为兵马司副指挥、京县县丞、京府经历、知县、布政司理问、按察司经历、布政司都事、盐运司经历和州判。
县丞设有自己的衙署办公，与主簿一起佐理知县，分掌一县之粮马、税收、户籍、巡捕等事务。每县设置县丞与否、设置人数多少，与该县的大小有关，有些事务繁多的县设几个县丞，而有些事务简单的县也可以不设县丞。
2、主簿：与县丞一样，为知县的副手，但品级比县丞低，只有正九品。主簿的来源有：监生、吏员、宣课司大使、兵马司吏目、司狱、府税课司大使、州吏目、府仓大使、巡检、典史、道库大使。主簿任满若予以升任的话，可以升为州判、按察司知事、府经历、县丞、盐运司知事、按察司照磨。
主簿的设置与县丞类似，有自己的专署办公，与县丞分管粮马、税收、户籍、巡捕等事。事繁之事设一人，事简之县可不设。
3、典史：典史的品级为未入流，掌管一县监察狱囚之事。若事简之县不设县丞和主簿，则县丞和主簿的职能也由典史一人兼领。
4、巡检：请代在各州、县的关隘、渡口等要冲之地设巡检司，掌缉捕盗贼、盘诘奸伪之事，相当于现在的派出所。巡检司的巡检为从九品官。
5、驿丞：驿丞管理各驿站，掌邮传及迎送过往官员之事，相当于现在的邮政局兼招待所的职能。驿丞的品级为未入流。
6、闸官：亦为未入流官，掌各闸储泄、启闭之事。相当于现在的水库管理人员。
7、税课司大使：亦为未入流官，掌税收的征收。
8、仓大使：未入流，掌仓库的保管与守卫。
9、河泊所大使：未入流，掌征收渔业税。
10、医学训科：未入流，为一县之医官，相当于现在的县立医院院长。
11、阴阳学训术：未入流，掌管星相（天文）。
12、僧会司僧会：未入流，掌管一县僧人。
13、道会司道会：未入流，掌管一县道士。
县衙除设有上述机构和人员外，还有知县私人聘任的幕僚。这些人或擅长刑律，或能写会算，或谙练官场事物，具有一定的聪明才智。知县聘请他们作为心腹为自己出谋划策，处理公务。他们泛称师爷，再按其专长分为书启师爷、刑名师爷、钱谷师爷。师爷们无俸禄和工食银，年终知县给予束修。他们往往左右知县施政之明暗，为官之清廉。他们和知县是宾朋关系，来去自由。
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