一个是农民军毕竟是农民军，军队的训练程度和组织程度和正规军是无法相比的，打打顺风仗还行，一旦受挫，及容易发生溃败。这也是历史上农民军往往被正规军镇压的原因。
当然也有农民军起义成功的，但无不是吸引了大批地主及知识分子，使政权和军队组织正规化，李自成的军队进城后就大私抢劫，一下子得罪广大地主阶级，传统知识分子，使其政权和军队组织程度始终未有质的改变。
第三是清军处于上升期，长期与明军作战也是久经战阵，清军的弓箭改革使之在远程打击能力大大加强，连骑射冠绝天下的蒙古都被满清吞并了。
明军自萨尔浒战役后，基本野战就不是大骑兵军团和强弓清军的对手，只能依靠工势防御，然而吴三桂降清，农民军在平原上和吴三桂的军队死磕，打得精疲力尽时，背后再被清军骑兵一冲，焉能不溃败，骑兵溃败还能逃走可能。步兵一溃败，没有结阵的步兵把后背留给骑兵，两条腿又跑不过四条腿，那就是留给骑兵随便的砍杀。
第四，还有一种说法，明末除了小冰河期造成的粮食大面积减产外，还流行瘟疫，据说是肺鼠疫，通过空气传播，起病急，病死率高。导致明军后期大败和北京基本没有防御能力，瘟疫的功劳很大。
农民军急匆匆地进驻北京城，大部队感染瘟疫，北征山海关途中发生大面积染病，部队战斗力锐减，疾病减员甚至比敌人的刀剑还厉害。农民军焉有不败之理。
第五是农民军往往是流寇主义，不注意根据地的建设和发展，确实明朝末年在灾害和流寇的作用下中国北方基本糜烂不堪。没有稳定的根据地，就没有稳定的兵源和粮食来源。一旦失败，就很难东山再起。
第六是古代的几十万大军往往是号称，古代往往十个人才能保障一个战斗人员。明末的流寇农民军往往是洗劫一地，抢光粮食，再裹挟当地的老百姓一起走。当地老百姓因为粮食都被抢光了，也只能跟着走，不然就是只能饿死。
因此农民军号称动不动几十万，但是大部分是拖家带口锅碗瓢盆各种家当。真正的青壮有一定战斗力的精锐也就几万，精锐一旦打光，剩下的老弱基本就是没战斗力。
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