海水珍珠产量很低，一个珠蚌只产一颗珍珠，养殖一年才能收获一次，养殖过程极为艰辛，成本高，淡水珍珠产量较高，一个珠蚌产多颗珍珠，成本相对较低。
1、形态：海水珍珠一般呈比较规则的正圆球形，而淡水珍珠则比较多的呈椭圆、扁圆形，且表面褶纹多;
2、大小：海水珍珠一般较淡水珍珠大，海水珍珠的珠径一般为6--7.5毫米，而淡水珍珠的颗粒则要小得多;
3、密度：一般海水珍珠的密度小于淡水珍珠;
4、生长周期：一般海水珍珠的生长周期为三年，而淡水珍珠则为一，二年;
5、成活率：一般海水珍珠的成活率为50%，而在此范围内的成珠者仅有40%;而淡水珍珠的成活率则要高得多;
6、珍珠产量：一般三个海水珠母贝才产生一个珍珠，而一个淡水珠母贝可以形成大约20个珍珠;
7、生长环境：海水珍珠更多是在开放的天然海水中生长(里面有更多的营养成分与浮游生物)，而淡水珍珠则更多的是在相对封闭的水域环境中生长;
8、药用功效：海水珍珠的药用成分含量一般高于淡水珍珠，药用价值更高。
最后一点，也是最关键的一点，由于中国近十多年的发展，环境污染越来严重，加上淡水养殖主要靠饲料饲养，产量高但其产品无机物质含量较高，而具有美容保健作用的有机物质含量很低。
海水有天然矿物质和营养成份，海水污染相对较少(特别是北海的海域污染更加少，北海的空气也是全国最好的三个城市之一，全国最大的氧吧之称)浮生物也较多，珍珠比较天然(养殖的海水珍珠，也是靠大海的自身提供的营养，而不是用饲料另一养大的)经过大海的孕育，低产量的海水珍珠能保证其有机质含量，这对美容保健非常的关键的作用!
珍珠从来源分，有两类：海水珍珠和淡水珍珠。海水珍珠在我国有一种，即产于广西、海南的马氏珠母贝(Pteriamartensii)所产的珍珠，称为“南珠”。淡水珍珠主要产于长江中下游地区，由蚌科动物三角帆蚌(Hyriopsis cumingii )或褶纹冠蚌(Cristariaplicata )产出。
在药典中，海水珍珠和淡水珍珠是同等入药的。在《日本化妆品原料规范》中，亦未对珍珠的来源加以区别。为什呢?
多种分析发现，淡水珍珠与海水珍珠的成分没有根本性的区别，淡水珍珠有3种氨基酸含量较海水低，2种与之持平，余下13种氨基酸的含量甚至较海水珍珠更高(如《中国药学杂志》1989 年第5期313医院翁林福等对淡水珍珠粉和海水珍珠粉的化学成份进行了分析比较。分析结果表明，淡水珍珠和海水珍珠的化学成份基本一致，还有更多研究也证明了这一点)。
现在，淡水珍珠与海水珍珠均实现了人工养殖。淡水珍珠用的是无核养殖技术。
海水珍珠用的是有核养殖技术，因此有一个用贝壳或者骨头等做成的核;而淡水珍珠采用的是无核养殖技术，因此其组成是100%纯珠质。
海水珍珠珍珠质厚度仅为0.3--0.8毫米，而淡水珍珠100%都是珍珠质。如果要制得100%的纯海水珍珠粉，必须把核去掉，价格高得惊人
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