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一般来说，如果怀疑患有胆囊结石，绝大多数的患者通过常规B超就能确诊。如果结石比较小就需要反复多次做B超。但凡是经验丰富的医生，都可以看出来胆囊结石的大小和数量，除非遇到技术不过硬的医生，可能看不出来病情。
对于病情比较重的患者，就需要做一系列的检查，包括血常规、尿常规、肝功、生化、核磁共振（MRI），看是否合并胆总管结石，做CT看是否合胰腺炎和肿瘤。如果怀疑胆囊结石进入胆管，可以选择做核磁共振胰胆管成像（MRCP）。
每个患者的胆囊结石症状不尽相同，通常来说，如果患者的上腹部，特别是右上腹或者剑突下疼痛，需要考虑胆囊结石的可能；有些患者会表现出消化道症状，例如恶心、呕吐、腹胀。
有些患者甚至会发烧，严重的会引起黄疸；还有些患者夜间平卧、正在睡觉时疼痛发作（体位改变导致结石堵在胆囊颈部）。这些不典型的症状往往会误导患者（或者医生），把它当做心脏病或者是胃病，做了很多检查都没有找到病因。
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