人猿首领的诞生源于一个善意的举动，人类灭绝的灾难始于一个基因药物公司，一个根治脑退化的梦。
病毒起因
GEN-SYS公司研发出编号为ALE112的药物，能治疗大部分脑疾病，先在黑猩猩身上做实验，效果显著，猩猩的智商明显提高。当公司准备筹备进行人体实验的时候，实验体突然变得不受控制，狂躁，暴戾并具有攻击性。老板觉得是这款药物未够成熟并具有副作用，然后把这款药物的研究回归到最初的起点。所有参与实验的黑猩猩统一进行安乐死，只有一只幸存下来，这就是黑猩猩暴怒的原因，是因为要保护刚出生的孩子，幸存下来的猩猩被这个项目负责人威尔领养了，并取名为凯撒。
随着凯撒年纪的增长，越发体现出猩猩不该有的智慧。而威尔的父亲脑退化十分严重，看起来一天比一天消瘦。威尔于心不忍，就去了GEN-SYS公司偷走了ALE112并在自己父亲身上做人体实验，令人惊讶的是，效果居然出乎意料的好，并且没有任何副作用。
ALE112毕竟只是一个雏形，药力自然后劲不足，不久威尔的父亲再度出现脑退化迹象。威尔就把一切告诉GEN-SYS公司老板，希望可以通过用公司的资源研发药力更加强的ALE112。老板听了即刻就将这个药物的研究提上日程，毕竟没有多少药物能拯救成千上万的生命，对于一个药物公司来说，ALE112无疑就是一座金山。新版药物很快就研究出来名为ALE113，并首次用于黑猩猩科巴身上，科巴久经辗转去过很多实验室，遍体鳞伤，无限扩大了对人类的憎恨。（科巴是人猿的灾难）ALE113药物是气体，实验过程中，科巴把工作者富兰克林的面具抓掉了，并且管道破裂，导致富兰克林吸入了ALE113，富兰克林就是病毒的源头。
富兰克林吸了ALE113之后身体出现了状况，感到不适，流鼻血，有一天对着邻居打喷嚏，弄得邻居一身血。不久，富兰克林的尸体被发现在自己的床上。
ALE113对猩猩无害，并且可以让猩猩提高智慧，但对人类却有致命伤害。
邻居来到了机场，并有流鼻血的症状，证明ALE113有极高的传染性，被感染的邻居把病毒带上了飞机，并传播到世界各地，灾难就这样毫无征兆的降临。
前作介绍
人类以为GEN-SYS公司研究的ALE113在猩猩身上做实验导致猩猩展现古怪的侵略性行为，导致猩猩逃离实验室，并在旧金山金门大桥与警察进行了6个小时的僵局，最终以凯撒为首的猩猩逃进“小红衫公园”缪尔树林结束。
金门大桥战役的10年后，逃进缪尔树林的猩猩大多数都吸入了凯撒偷出来的ALE113，智慧显著提升。智能进化的猿族这10年在缪尔树林里繁衍，建造出属于猿人的文明，而人类这10年宛如地狱，猿流感传染力惊人，攻击力极强，大概每500人之中才有一名幸存者，许多家庭分崩离析。幸存们聚居在旧金山，与猿人只有一河之隔。
在旧金山苟延残喘的人类面临能源危机，他们试图利用森林腹地的大坝发电站提供能源，一支由马尔科姆带领的维修小队登陆了凯撒的领土，马尔科姆跟凯撒交代了入侵的缘由，凯撒承诺帮助人类修复发电器，并跟马尔科姆说，自己并不想发动战争，渴望和平。
但是猿族早已分成两派，科巴对人类的憎恨在这10年并没有减退，而且酝酿出大阴谋。科巴首先把猿人首领凯撒枪杀了，然后命令手下放火，让猿族这10多年来建造的家园毁于一旦，并嫁祸于人类。科巴带领着群龙无首的猿族，进军人类最后一座堡垒，大难不死的凯撒赶来终止科巴的阴谋，但是人猿之间的误会已经越来越深，难以解释，人猿之间的大战在所难免。最终凯撒占领了这座城池，而人类军队也将到来，战争一触即发。病毒没有杀死那些人，或许将在战斗过程中死亡，不久，就不会有任何人存活，而地球，将彻底变为猿球。
原著作者
《猩球崛起》是1968年拍摄的《人猿星球》系列的前传。
《人猿星球》于30年后的2001年重新拍摄了新版《决战猩球》
1968年的《人猿猩球》改编自法国作者皮埃尔·布勒的同名小说，他在1963年游览动物园的时候，看见大猩猩跟人类的互动突发创作灵感，然后就写出这部脍炙人口的科幻作品。原著小说主要讲述2029年，人类训练黑猩猩驾驶宇宙飞船，在一场地磁风暴中，黑猩猩离奇失踪，为了就出黑猩猩，人类穿越风暴，来到了正在进行人猿大战的未来世界，几经波折，终于平息了未来世界的人猿大战，人类回到了原来安定繁荣生活的世界中，却意外发现，这个熟悉的世界变成了人猿统治的世界。
窗
电影中几次出现的窗，是预示着凯撒的心路历程。
威尔家的窗
凯撒喜欢透过窗看外面精彩的世界，对自由的渴望。即使曾经到过外面，被邻居痛扁，但是还是对外面的世界充满憧憬。
猩猩监狱的窗
因为咬断了邻居的手机，所以凯撒被送到了猩猩监狱。在牢房里，被人类欺负，被里面的猩猩欺负。所以凯撒在牢房墙壁用石头画了个窗。是对家的想念，希望主人威尔能尽快把自己接回家。
路上路标上的窗
因为凯撒在猩猩牢房想了很久，即使回到威尔身边，威尔也是对他宠物对待，栓上狗链子。不如跟牢房里的同类逃去森林，寻求真正的自由。
猿族家园窗标记
凯撒对人类还念念不忘，借此标记寄托对前主人威尔的思念。毕竟10年，猿族不可能不知道人类这些年的灾难，或许凯撒早已知道威尔不在人世，借此标记睹物思人。
猿族内部的战斗告一段落，北方的人类军队浩浩荡荡的到来。凯撒要面临的不是民兵，而是一支训练有素的军队。对于人类而言，这是一场地球的争夺战。到底存留在凯撒心中仅存的那点善，会不会换来人与猿之间的平稳安定？积聚了10年的怨恨终于爆发，猿族的命运就掌握在凯撒手中……
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