虽然95式枪族比起我军过去装备的枪族在战术性能上提到提高，但在部队使用中，也提出了一些95式枪族的缺点，例如：
·受研制时认识和技术水平的限制，其扩展功能方式采取的是最简单的连接座式，这种方式虽然结构简单，但无法形成模块式功能，难以满足部队对功能多样的需求。
·简易夜瞄装置采用放射性同位素钜147通过填涂方式装配，使用中存在亮度不足和容易脱落问题，而且钜147的半衰期也不能满足军品长期贮存的要求，给部队使用带来许多不便；研制的二代微光瞄准镜由于价格问题不可能全面装备，而且200m的夜视距离也显不足，全天候作战能力有待提高。
·光学瞄具瞄准不便是部队反映比较多的问题，这主要是95式自动步枪受“应满足以机械瞄具为主要瞄准方式”要求的限制而造成的，安装光学瞄准镜后无法舒适贴腮瞄准。
受“应满足以机械瞄具为主要瞄准方式”影响，95式步枪在安装光学瞄准镜后无法舒适贴腮瞄准。
·91B下挂式防暴震撼弹发射器击发方式也不方便，因为类似于M16的有托枪通常利用弹匣作为下挂榴弹发射器的握持部位，95式自动步枪由于采用无托结构，加装下挂防暴榴弹发射器后只能利用小握把作为握持部位，实际使用时不方便。
·95式枪族采用无托结构使全枪布局十分紧凑，但也带来射击时射手贴腮靠烟源太近，没有燃烧完全的火药燃气从抛壳窗、拉机柄槽和上护盖散热槽溢出，直接刺激射手眼睛或弥漫在瞄准基线上，以至影响射手持续瞄准射击，这种情况也给武器正常使用带来不便。
·5.8mm普通弹采用的双基扁球药燃烧不完全，95式枪族在发射2,000发弹（全枪需要清洗的射弹数）后，通常都会出现气体调节器和活塞取出困难的问题，而且射弹多后，还会出现导气孔由于火药残渣堆积变小的问题。另外为了获得好的外弹道性能，5.8mm普通弹将部分难题转移到了内弹道，造成枪口压力过高，给解决枪口噪声和火焰问题带来许多困难。5.8mm普通弹采用的是常规雷汞底火，存在长期贮存后底火锈蚀问题，给可靠使用留下隐患。
·塑料件容易磨白，这主要是塑料材料本身的问题。要满足低温-45℃的可靠使用要求，塑料中的玻璃纤维含量就不能太高，而磨白问题主要是塑料强度不足，这个矛盾比较难解决，塑料件磨白后影响了95式枪族的美观。
·95式枪族进行分解结合时，有时会出现散件丢失和零件倒装、错装问题，这种情况给武器正常使用带来不便。
上述问题有许多均是在部队试用初期提出的，95式枪族一直在改进，有部分问题现在可能已经得到解决。目前没有公布改进过多少个型号。但从已经公开的图片分析，至少是经过了3个阶段。这3个阶段的区别特征可从拉机柄的形状和上护木的散热孔数量识别出来。
另外，在关于95式枪族的评论中经常看到有人批评其提把过高，导致瞄准射击时上身暴露较多。但这样的问题并非95式枪族特有。事实上，所有的直枪托武器（如M16、G36、FN SCAR等）都由于贴腮位置高于枪管位置，所以瞄准基线与枪管轴线之间的高度是比弯枪托武器（如AK、M14）要高。但直枪托带来的好处是射击时枪口跳动小、容易控制、点射精度高。见过真枪的人都会知道其实95式枪族的瞄准基线高度与其他的直托枪相差无几，并不是真的“很高”。
95式枪族最大的争议之一就是空仓挂机柄的问题。最初立项时部队提出有此要求，但后来由于弹匣材料问题而不得不说服部队放弃此要求，后来朵英贤还专门撰文解释空仓挂机柄的效用。但在他所透露的“95改”方案上，又重新采用了空仓挂机柄。
95还有一个遭人诟病的问题，就是快慢机的操作位置不够便捷。虽然熟练的射手可以迅速摸到快慢机并凭经验进行正确的操作，但还是不如M16、G36这一类用射击手拇指就能轻松拨动的快慢机方便。
由于美国不能进口97式步枪，因此美国人只能通过香港生产的玩具来体验95/97的人体工效。图中这个戴眼镜的男人是6.5mm格伦德尔弹的发明人、阿历山大公司的老板比尔·阿历山大在SHOT SHOW2008上体验RS 97，虽然没人告诉过他，但有当兵经验的他一上手就发现枪托后上方的凸起是个很实用的设计，左手扶到枪托上时借助枪托凸起定位，不需要用眼观察就能迅速让拇指准确地摸到快慢机上。
以下是95式枪族与美国M16枪族的简单量化对比：
总体来看，95式班用枪族达到了当初军方提出的研制要求，与以往的56式、81式枪族相比，威力、精度、人机功效等指标均有超出。但与西方的自动步枪相比，因为对枪械使用的认识不足和国内机械加工水平的限制，95式仍不如不断改进的M16/M4枪族、及近年出现的新式自动步枪。下表是网易军事对95式班用枪族的排名及国产化率评估，5星为满分：
