网易首页 > 网易科技 > 科学探索 > 正文

国家基因组科学数据中心公开新型冠状病毒全基因组序列

0
分享至

(原标题:国家基因组科学数据中心首次公开新型冠状病毒全基因组序列)


澎湃新闻记者 贺梨萍

国家基因组科学数据中心(NGDC)信息显示,1月26日,该中心收录了由中国医学科学院/北京协和医学院病原生物学研究所提供的5株2019新型冠状病毒全基因组序列。

这是自2019年12月该病爆发以来,国内公共数据平台首次公开发布数据。此前科学家陆续获得的2019新型冠状病毒基因组序列一般递交到全球流感序列数据库(GISAID)和美国国家生物技术信息中心(NCBI)的GenBank数据库。

此前的1月22日,国家基因组科学数据中心正式发布2019新型冠状病毒信息库。该库整合了世界卫生组织(WHO)、中国疾病预防控制中心(CDC)、美国国家生物技术信息中心、全球流感序列数据库等机构公开发布的冠状病毒基因组序列数据、元信息、学术文献、新闻动态、科普文章。同时,对不同冠状病毒株的基因组序列做了变异分析与展示。

2019新型冠状病毒信息库基于不同参考基因组序列开展2019-nCoV病毒株基因组变异分析,并对结果进行了统计与可视化展示。通过对全基因组序列相似性比较和变异位点分析,获取2019-nCoV病毒株之间、2019-nCoV病毒株与SARS冠状病毒以及与类SARS冠状病毒蝙蝠株之间的变异程度、变异区域、变异碱基的详细信息。

对2019-nCoV病毒株的基因组变异分析为追溯病毒来源、追踪病毒株变异路径、防控新型冠状病毒引发的疫情、治疗病毒性肺炎提供重要的数据基础与决策支持。

上述资源库发布之际,中科院北京基因组所研究员、国家基因组科学数据中心主任鲍一明在接受《中国科学报》采访时曾表示,“我们这个数据库发布以后,就有单位联系要将武汉新型冠状病毒基因组的数据送到这儿来,而不是先到国外然后国内研究人员再去拿回来‘出口转内销’了。”

国家基因组科学数据中心介绍,冠状病毒属于套式病毒目、冠状病毒科、冠状病毒属,是一类具有囊膜、基因组为线性单股正链的RNA病毒,是自然界广泛存在的一大类病毒。某些冠状病毒会感染人类并引起疾病,比如中东呼吸综合征(MERS)和严重急性呼吸综合征(SARS),其症状可从普通感冒到重症肺部感染。

此次在武汉首先发现的冠状病毒是一种先前尚未在人类中发现的病毒株系,被WHO命名为2019新型冠状病毒(2019-nCoV)。NCBI的病毒分类工具PASC将2019-nCov分类为严重急性呼吸综合征相关冠状病毒种(Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus),该种还包含2003年爆发的SARS病毒,两者基因组序列相似度为80%。

此次发布的5株2019新型冠状病毒基因组序列的序列号为GWHABKF00000000、GWHABKG00000000、GWHABKH00000000、GWHABKI00000000、GWHABKJ00000000,相关项目编号为PRJCA002165。

以上序列可在国家生物信息中心/国家基因组科学数据中心的项目库或者冠状病毒序列库检索并下载,无需注册或向数据递交者申请。

相关推荐
热点推荐
亲自解读!梅西谈晃倒博阿滕:即兴发挥,几乎没思考就做出了动作

亲自解读!梅西谈晃倒博阿滕:即兴发挥,几乎没思考就做出了动作

直播吧
2024-04-27 10:14:22
加沙的乱葬岗,迫使美国和以色列改变幕后交易?

加沙的乱葬岗,迫使美国和以色列改变幕后交易?

中国新闻周刊
2024-04-26 18:28:40
最新消息!29岁林高远传来喜讯,陈幸同乐开花,球迷纷纷送祝福

最新消息!29岁林高远传来喜讯,陈幸同乐开花,球迷纷纷送祝福

大咖唠体育
2024-04-27 12:44:23
新华社消息|港珠澳大桥出入境车辆突破1000万辆次

新华社消息|港珠澳大桥出入境车辆突破1000万辆次

新华社
2024-04-27 18:22:22
重要论坛再举办!谌贻琴以这一身份出席

重要论坛再举办!谌贻琴以这一身份出席

政知新媒体
2024-04-27 22:05:56
公知们再不努力,工业皇冠上的明珠可就要掉光了!

公知们再不努力,工业皇冠上的明珠可就要掉光了!

52赫兹实验室
2024-03-23 15:06:06
维尼修斯为皇马出战258场比赛追平贝尔,贡献78球61助

维尼修斯为皇马出战258场比赛追平贝尔,贡献78球61助

直播吧
2024-04-27 06:24:27
0-0!AC米兰全场0射正,门将6次扑救成遮羞布,尤文三轮不胜!

0-0!AC米兰全场0射正,门将6次扑救成遮羞布,尤文三轮不胜!

钉钉陌上花开
2024-04-28 03:58:50
最新!武汉医保有重要变化!

最新!武汉医保有重要变化!

越乔
2024-04-27 22:23:16
关注民生的煤气一词,竟成为敏感词语,实在想不明白,怎么会这样

关注民生的煤气一词,竟成为敏感词语,实在想不明白,怎么会这样

天闻地知
2024-04-24 14:06:59
天津人社发布公告,事关养老金,4月28日前完成认证,涉及4999人

天津人社发布公告,事关养老金,4月28日前完成认证,涉及4999人

小强财艺
2024-04-26 21:46:14
再次垫底!吴艳妮换了招牌动作无济于事,赛前豪言成空,网友炸锅

再次垫底!吴艳妮换了招牌动作无济于事,赛前豪言成空,网友炸锅

大秦壁虎白话体育
2024-04-27 23:39:28
美国智库分析中国策略后,得出结论:中国在下一盘无与伦比的大棋

美国智库分析中国策略后,得出结论:中国在下一盘无与伦比的大棋

祥瑞
2024-04-27 10:53:07
发“国难财”?疫情几年他捞金222.8亿,登顶富豪,扬言活到120岁

发“国难财”?疫情几年他捞金222.8亿,登顶富豪,扬言活到120岁

南风西洲
2024-04-20 22:32:54
媚而不俗,高启兰隆妮不愧是人间尤物,与53岁的于和伟激吻!

媚而不俗,高启兰隆妮不愧是人间尤物,与53岁的于和伟激吻!

慎独赢
2024-04-20 13:07:10
斯诺克世锦赛战报!中国独苗留住希望,黑马第一个晋级8强

斯诺克世锦赛战报!中国独苗留住希望,黑马第一个晋级8强

土土女排
2024-04-27 15:27:04
央行出大招,楼市或大涨!

央行出大招,楼市或大涨!

你好美丽
2024-04-27 13:30:33
美女写真欣赏-284

美女写真欣赏-284

农人老寓
2024-04-27 12:07:25
郑州渣土车大街上演大鱼吃小米  2人当场死亡 谈起渣土车居民色变

郑州渣土车大街上演大鱼吃小米 2人当场死亡 谈起渣土车居民色变

阿SIR观察
2024-04-27 16:16:25
女子在工地穿梭,专挑休息时闯进工棚,工人:送上门的福利不敢要

女子在工地穿梭,专挑休息时闯进工棚,工人:送上门的福利不敢要

古装影视解说阿凶
2024-04-27 17:15:11
2024-04-28 05:04:49

科技要闻

特斯拉这款车型刚上市几天,就上调价格

头条要闻

租车开网约车遭遇车损"套路":有人扣完押金还要倒补

头条要闻

租车开网约车遭遇车损"套路":有人扣完押金还要倒补

体育要闻

切尔西扳回一球!加拉格尔抢断,马杜埃凯破门

娱乐要闻

金靖回应不官宣恋情结婚的原因

财经要闻

北京房价回到2016年

汽车要闻

5月上市/智能化丰富 海狮 07EV正式到店

态度原创

教育
家居
旅游
健康
数码

教育要闻

高三女生扶起摔倒大妈却被反咬一口,拿出监控作证后,大妈破防了

家居要闻

光影之间 空间暖意打造生活律动

旅游要闻

散装河北,冀北、冀东、冀中、冀南如何划分?

这2种水果可降低高血压死亡风险

数码要闻

小米米家电热水器 P1 开售:60L 双胆速热,首发价 1999 元

无障碍浏览 进入关怀版
×