河北医科大学研究人员在E2F1转录激活的NRSN2通过AKT/mTOR信号通路促进食管鳞癌进展的机制研究中,使用BIOG细胞DNA提取试剂盒成功提取出人食管癌KYSE150细胞样本中DNA!
食管癌细胞KYSE150增殖旺盛、胞内核酸酶活性较高,细胞代谢产物丰富,给DNA提取带来一定挑战。该细胞黏附能力偏弱,消化吹打过程容易发生细胞破损,胞内核酸释放后易被内源核酸酶降解,造成DNA片段断裂。KYSE150细胞脂类、蛋白代谢水平高,裂解后会产生较多蛋白质以及多糖类杂质,杂质若去除不充分,容易共沉淀混入DNA洗脱产物,造成DNA纯度下降,A260/A280 比值偏离理想区间,会抑制后续PCR、建库等下游分子反应。此外该细胞传代过程易出现细胞团块,裂解不充分时部分基因组DNA被包裹在细胞团内部,会降低DNA得率;若裂解过度又会引发基因组大片段断裂,难以获取完整高分子量基因组DNA,需平衡裂解强度与纯化除杂效果。
研究者在尝试过几款提取试剂盒后,最终使用BIOG细胞DNA提取试剂盒成功提取出了人食管癌KYSE150细胞样本中的DNA,并以此为模板成功扩增了NRSN2启动子区并进行了双荧光素酶报告基因的载体构建。
相关文献:E2F1转录激活的NRSN2通过AKT/mTOR信号通路促进食管鳞癌进展的机制研究
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