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腺相关病毒( adeno-associated virus , AAV )是一类无包膜小型细小病毒。重组 AAV ( rAAV )具有安全性较好、可转导分裂和非分裂细胞以及转基因表达持久等优势,已成为基因治疗领域最重要的递送平台之一。 然而,许多应用仍依赖较高的载体剂量,既增加生产负担,也可能提高针对衣壳或载体基因组的免疫反应风险。因此,阐明 AAV 从细胞表面进入、穿越 胞 内膜性区室并到达细胞核的完整路径,是进一步提高转导效率和安全性的关键。
AAV 进入细胞通常经历两步受体识别:首先结合细胞表面糖链,随后与蛋白受体 AAVR (又称 KIAA0319L )结合。 AAVR 胞外的五个 PKD 可直接识别不同血清型的 AAV 衣壳,但其短小的胞质 C 端尾部如何连接胞内运输机器,此前一直不清楚。已有研究提示, AAV 需要沿内体到反式高尔基网络( trans-Golgi network , TGN )的逆向运输路径移动;然而,负责把 AAVR 携带的病毒囊泡递送至 TGN 的宿主衔接因子仍未被鉴定。
近日,美国堪萨斯大学医学中心( University of Kansas Medical Center )邱建明团队联合阿拉巴马大学伯明翰分校颜子颖团队在PNAS发表题为TBC1D23-AAVR interaction drives endosome-to-TGN trafficking required forrAAVtransduction的研究论文 。 该研究鉴定出 TBC1D23 是连接 AAVR 与 TGN 的关键胞内运输衔接蛋白,并揭示 AAVR 胞质尾部的酸性残基簇是招募 TBC1D23 、推动 AAV 从内体到 TGN 逆向运输的核心信号。 研究表明, TBC1D23 与 AAVR 胞质 C 端可直接 以纳摩尔亲和力结合;敲除 TBC1D23 会显著降低多种 AAVR- 依赖的 AAV 血清型在多种人源细胞以及 人气道 上皮中的转导,并阻断 AAV 衣壳在 TGN 的汇聚。破坏 AAVR 的酸性 残基簇会完全 消除 TBC1D23 结合,使 AAV 无法有效到达 TGN 和细胞核,但并不影响病毒内 吞 。该工作由此确定了一个位于 病毒 受体 C 端、决定 AAV 能否完成有效转导的胞内运输 关键决定 点。
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首先,研究人员确认 AAVR 参与 AAV 的早期进入过程。 在野生型 HEK293 细胞中, AAV5 衣壳可在 转导早期与细胞表面的 AAVR 共同定位,并随后出现在 STX5 内吞囊 泡 和 TGN46 阳性 反式 高尔基体网络( TGN ) 区室。相比之下, AAVR 敲除使 2 小时内化的 AAV5 载体基因组减少约 98% ,提示 AAVR 既参与病毒进入,也为后续胞内运输提供起点。
随后,研究团队以 AAVR 胞质 C 端为 “ 诱饵 ” 寻找运输衔接蛋白。 通过 GST-AAVR-C 亲和纯化和定量质谱,研究人员鉴定出 TBC1D23 、 COPG1 、 ASAP1 和 COPS3 等候选蛋白。功能筛选显示, TBC1D23 是其中对 AAV 转导影响最显著的因子:在 HEK293 细胞中, TBC1D23 敲除使 rAAV2.5T 阳性细胞减少约 95% ,荧光素酶活性下降 73% ;在 HeLa 和 Huh7 细胞中,转导也下降 72.4%-80.7% 。此外, rAAV2 、 rAAV5 和 rAAV8 在不同细胞中的转导下降 55.6%-80.2% 。
更重要的是,在气液界面培养的极化 人气道 上皮( HAE-ALI )中,敲除 TBC1D23 同样显著降低 rAAV2.5T 的长期报告基因表达。该模型可重建人近端气道的假复层结构,因此这一结果提示 TBC1D23 不仅在常规细胞系中发挥作用,也与面向囊性纤维化等肺部疾病的 AAV 基因递送密切相关。
接下来,研究人员证明 TBC1D23 与 AAVR 之间存在直接、选择性的蛋白互作。 体外 GST 拉下 (pulldown) 显示, AAVR 胞质 C 端可直接 结合 TBC1D23 的 C 端 PH 样支架结构域。生物层干涉技术( BLI )进一步测得平衡解离常数 KD 为 44.2 nM ,而 GST 对照没有可检测结合。这一结果排除了必须依赖大型高尔基复合物间接连接的可能,确立了 AAVR-TBC1D23 之间的受体 - 衔接蛋白关系。
AAVR 胞质尾部究竟通过什么信号招募 TBC1D23 ? 研究人员比较了 AAVR-C 中多个潜在分选基序,并利用 AlphaFold 3 对 AAVR-C 与 TBC1D23-C 复合物进行结构预测。模型提示, AAVR-C 中央的酸性残基簇( acidic residue cluster , ARC )与 TBC1D23-C 表面的碱性残基形成互补界面,其中 D1010 和 D1011 可能位于关键接触区域。
为验证这一预测,团队构建了 ARC 突变体 AAVR- mARC ,并以 C 端双亮氨酸 基序突变体 AAVR- mLL 作为对照。 BLI 结果显示, ARC 突变完全消除了 AAVR-C 与 TBC1D23-C 的结合;相反, mLL 突变仍 保持稳定结合, KD 约为 59.7 nM 。由此可见, ARC 并非一般性的尾部序列,而是 TBC1D23 识别 AAVR 的主要运输信号。
进一步的互补实验把蛋白结合与病毒运输功能联系起来。 研究人员在 AAVR 敲除细胞中分别稳定表达 AAVR-WT 、 AAVR- mARC 或 AAVR- mLL 。 AAVR-WT 与 mLL 均可恢复 rAAV2.5T 转导和衣壳在 TGN46 阳性区室中的富集,而 mARC 无法恢复,表型与 AAVR 缺失近似。 mARC 细胞中的 AAV 衣 壳主要 停留在外周点状区室,衣壳与 TGN46 的重叠显著下降。
值得注意的是, ARC 突变并未降低 rAAV2.5T 、 rAAV5 或 rAAV8 的病毒内化,却显著减少载体基因组进入细胞核。对于 rAAV5 和 rAAV8 , mARC 使转导下降 98%-99% ,而 mLL 不产生类似影响。这将 TBC1D23-AAVR 互作的作用位置精确限定在 “ 内 吞 之后、入核之前 ” ,说明其主要控制 AAV 从 内吞囊 泡 通向 TGN 的逆向运输,而不是细胞表面结合 或内吞本身 。
最后,研究团队通过共聚焦成像和内体免疫沉淀重建了 AAV 的运输路线。 在对照细胞中,进入细胞的 AAV5 衣壳在核 周区域 与 AAVR 和 TGN46 共同富集; TBC1D23 缺失后,衣壳滞留在细胞外周,与 TGN46 或 GM130 的共同定位明显下降,而 AAVR 总蛋白水平没有变化。这说明 TBC1D23 主要调节 AAVR 的亚细胞定位和 囊泡 递送,而不是 AAVR 的稳定性。
内体免疫沉淀显示, AAVR 相关囊泡中可检测到 AAV 衣壳、 TGN46 和 STX5 ,但检测不到早期内体标志 Rab5 ; TBC1D23 相关囊泡中则可检测到 AAV 衣壳、 AAVR 和 TGN46 ,而 STX5 和 Rab5 阴性。这些结果支持一个分步模型: AAV-AAVR 复合物经 CLIC/GEEC 相关 内吞途径 进入 STX5 阳性 内 吞 囊 泡 ,随后 AAVR 胞质尾部的 ARC 招募 TBC1D23 。 TBC1D23 进一步连接 WDR11-FAM91A1 复合物以及 TGN 上的 golgin-97/245 ,从而捕获、系留并停靠携带 AAV 的囊泡,使其在 TGN 汇聚。
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图 . TBC1D23 连接 AAVR 与 WDR11-FAM91A1/ golgin 系留机器,促进 AAV-AAVR 复合物由 内吞囊泡 向 TGN 运输。
综上,这项研究将 AAVR 的功能从 “ 衣壳结合与进入受体 ” 拓展为 “ 胞内货物分选受体 ” : AAVR 不仅在细胞表面识别 AAV ,其胞质尾部还通过 TBC1D23 主动接入逆向运输机器。 TBC1D23 因此构成一个受体近端的关键运输检查点,决定内化的 AAV 能否从内体到达 TGN 、进一步进入细胞核并产生有效转导。这一发现 补充 了 AAV 进入路径中的一个重要缺口,也为载体优化提供了新的宿主 - 病毒界面。未来可通过解析 AAVR-TBC1D23 复合物结构、寻找增强该界面的药理或工程化策略,促进逆向运输并在保持疗效的同时降低载体剂量。
堪萨斯大学医学中心 Xiujuan Zhang (张秀娟)博士为论文第一作者, Jianming Qiu (邱建明)教授为通讯作者。阿拉巴马大学伯明翰分校 Ziying Yan ( 颜子颖 )教授参与研究设计与论文撰写。
原文链接:https://doi.org/10.1073/pnas.2605086123
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