广东
近日，石河子大学联合华中农业大学在《Genome Biology》期刊上发表题为“Multi-parent mapping reveals epistatic architecture and elite haplotypes for multi-trait improvement in cotton”的研究成果。
研究团队历时12年，利用8个遗传背景丰富的棉花亲本，构建了包含319个重组自交系的多亲本高级世代互交群体，即MAGIC群体，并对产量、纤维品质、生育期和株型等19个重要农艺性状开展多环境鉴定。同时，研究整合了318份1978年至2024年间审定的新疆棉花品种，系统分析新疆棉花近半个世纪的现代育种选择轨迹。
通过结合SNP标记和亲本同源片段分析，研究共鉴定出111个SNP数量性状位点和15个亲本单倍型数量性状位点。进一步开展全基因组上位性互作分析，发现3000余个隐匿遗传位点。这些位点单独作用时效应较弱，却可通过特定基因组合显著影响农艺性状，表明棉花复杂性状不仅受主效基因控制，也受到广泛基因互作的调节。在新疆棉花品种群体中，研究鉴定出520个在现代育种过程中持续受到选择的基因组区域。通过整合遗传定位、优异单倍型、上位性互作和育种选择信息，团队建立了多性状协同优化框架，用于筛选同时携带产量和纤维品质有利等位基因的优异材料。该框架在MAGIC亲本衍生品种庄稼汉902和华新103中得到验证，显示出协调提升产量和纤维品质的育种潜力。
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