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近10万全球队列实锤:不同人种致病突变天差地别,附门诊筛查实操方案
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撰文:周晗
我们对帕金森病基因的认知,大半都“偏科欧美”
做帕金森病基因检测、跟进靶向新药临床试验的神经内科同行,几乎都会遇到同一个现实难题:现有的基因突变数据库、新药入组受试者,白人样本占比超九成。长久以来,全球帕金森病遗传学研究存在一块巨大短板——75%以上遗传数据均来源于欧洲人群,东亚、非洲、拉美、中东人群的帕金森病遗传图谱长期处于空白状态。
举个很扎心的行业数据:2023年一项全球单基因帕金森病汇总分析显示,91%检出致病/风险突变的患者都是白人。临床工作中,我们拿着基于欧美人群建立的基因解读标准,去给亚裔、非洲裔患者解读基因报告,天然存在巨大判断偏差。
2026年《柳叶刀·神经病学》刊发全球帕金森病遗传学计划(GP2)近10万人跨种族横断面观察研究[1],用海量、多元化人群遗传数据,完整揭露帕金森病致病突变的种族差异化真相,也给精准诊断、新药研发敲响警钟:如果研究视野只局限欧美人群,我们永远研发不出适配全球所有患者的普惠型帕金森病精准疗法。
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图:研究截图
史上最大规模全球队列:近10万受试者,三成来自被忽视人群
本次研究依托GP2第11版回溯数据开展,总样本量99783人,包含帕金森病确诊患者58559例、无神经退行性疾病健康对照41224例,覆盖全球11大遗传祖先人群:非洲、非洲混血、德系犹太人、拉美及美洲原住民、中亚、复杂混合血统、东亚、欧洲、芬兰、中东、南亚。
本次研究最大突破:共计29001人(占总样本29%)来自过往科研极少覆盖的非欧洲、非德系犹太人群,也就是我们临床日常接诊最多的亚裔、非洲、拉美患者。
研究团队依据国际运动障碍协会(MDS)遗传运动障碍命名指南,筛查18个与帕金森病、不典型帕金森综合征强相关基因,并划分三大类别:
1.常染色体显性帕金森病核心基因:LRRK2、SNCA、VPS35、RAB32
2.早发常染色体隐性帕金森病基因:PRKN、PINK1、PARK7
3.不典型帕金森综合征相关基因:ATP13A2、DCTN1、DNAJC6、FBXO7、JAM2、RAB39B、SLC20A2、SYNJ1、VPS13C、WDR45
同时区分两类具备临床价值的基因变异:
1.致病变异:依据ACMG、ClinVar标准判定为致病性/可能致病性,单基因即可诱发帕金森病;
2.风险变异:显著提升患病风险,是当前全球临床靶向药物核心靶点,以GBA1、LRRK2两大基因为代表。
同一种帕金森病,不同人种的“肇事基因”完全不一样
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GBA1:全人类通用风险靶点,但突变亚型自带“地域特产”
GBA1是本次研究实锤的全球各人群最高频风险基因,所有种族均能检出携带者,但主流突变亚型天差地别,完美印证“一方人种,一种突变”:
非洲/非洲混血人群:内含子突变rs3115534G绝对主导,非洲帕金森病患者GBA1携带率高达53.1%;该变异在欧美基因数据库中几乎无记录,是非洲人群特有风险位点;
德系犹太人:p.N409S为头号突变,16.8%的帕金森病患者携带GBA1变异;
欧洲、芬兰、中亚人群:p.E365K、p.T408M是最常见突变;
东亚人群:突变谱极度繁杂,共计检出40余种不同变异,p.L483P占比显著高于其他人种;
南亚人群:独有高频致病风险突变p.L483R。
临床关键提示:所有种族中,携带GBA1风险突变的帕金森病患者,发病年龄均比散发性患者提前3~8岁,是预判早发帕金森病的重要基因标志物,不过不同族群的早发年龄差值存在明显个体差异。
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LRRK2:欧美中东靠G2019S,东亚是完全独立的突变体系
LRRK2激酶抑制剂是现阶段临床试验最热门赛道,该基因突变的种族分化程度远超GBA1,堪称“东西半球两套发病剧本”:
德系犹太人、中东、欧洲、拉美人群:p.G2019S致病变异占绝对主流;其中德系犹太帕金森病患者携带率10.7%,为全球LRRK2致病突变最高发人群;
东亚人群:几乎不存在p.G2019S,两大特有风险突变p.R1628P、p.G2385R合计覆盖12.6%的东亚帕金森病患者,同时存在东亚特有致病变异p.R1067Q;
非洲人群:既往学界普遍认为LRRK2突变在非洲裔中极其罕见,本次研究首次检出非洲人群LRRK2致病突变携带者,填补了该人群遗传研究空白。
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PRKN隐性突变:亚洲、中东青年早发帕金森病的“隐形元凶”
PRKN是常染色体隐性早发型帕金森病核心基因,常伴随基因大片段缺失、重复,本次研究总结出清晰人群规律:
1.德系犹太人群几乎未检出双等位PRKN致病变异;
2.中东人群PRKN双等位突变携带率最高(1.3%),东亚、南亚、中亚紧随其后;
3.大量仅携带单条PRKN致病变异的杂合子,其中41.7%患者发病年龄≤50岁,提示单杂合突变可能协同其他基因、环境因素提前诱发疾病。
临床提醒:接诊青年型帕金森病患者,不能只筛查LRRK2、GBA1单点突变,必须同步完善PRKN拷贝数变异检测。
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小众致病基因:人群富集特征一目了然
SNCA基因倍增、VPS35、PINK1突变整体全人群罕见,但同样存在明确种族偏好:东亚PINK1突变患者几乎全部携带p.L347P;VPS35突变在亚洲人群检出率高于欧洲;RAB32致病变异仅在欧洲、中东人群中检出。
直击临床三大痛点:现有基因检测、新药试验,对非欧美患者并不公平
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基因解读标准“欧美中心化”,亚裔、非洲裔易漏诊、误判
ClinVar等全球权威变异数据库中,超70%变异致病性证据均来自欧洲人群。大量东亚特有LRRK2、GBA1突变,在系统内被标注为“意义未明变异(VUS)”。并非这类突变无致病风险,而是缺少对应亚裔人群对照数据支撑。
举个真实临床场景:40岁东亚早发帕金森病患者检出LRRK2 p.G2385R,按照旧版欧美参考标准仅判定为可疑风险;但本研究证实该突变在东亚人群中明确和帕金森病发病强相关,若仅依靠白人数据库解读,极易错过精准靶向治疗机会。
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靶向新药临床试验,全球站点分布严重失衡
论文配套全球临床试验地图清晰显示:目前针对GBA1、LRRK2突变携带者的临床研究中心,绝大多数集中在欧洲、北美,非洲、东南亚、南亚几乎无试验站点。
由此衍生两大现实医疗不公:①新药疗效、安全性数据仅代表欧美人群,无法确认东亚、非洲患者用药后的药效、不良反应是否存在差异;②非欧美患者几乎没有机会参与前沿精准治疗临床试验,基因靶向疗法沦为发达国家人群专属医疗福利。
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遗传咨询不能照搬欧美经验,家族史参考价值分人种
不同种族致病突变携带率差异巨大,家族史比例天差地别:德系犹太帕金森病患者24.7%存在帕金森病家族史,中亚人群仅8.4%;隐性基因高发的东亚、中东青年帕金森病,家族史往往不典型,极易被误判为散发性疾病,遗漏家系基因筛查。
落地临床:给神经科医生的4条实操诊疗建议
结合本次近10万人多祖先遗传大数据,整理可直接用于日常门诊、遗传咨询的实用规范:
➤1.按人种定制基因筛查套餐:欧美患者优先筛查LRRK2 p.G2019S、GBA1 p.N409S/E365K;东亚患者重点覆盖LRRK2 p.R1628P/G2385R、完整GBA1突变谱、PRKN/PINK1;非洲人群优先检测GBA1 rs3115534-G。
➤2.50岁以下早发性帕金森病,常规加做基因拷贝数变异检测:东亚、中东青年患者,除单点测序外,必须完善PRKN、SNCA大片段缺失/重复检测。
➤3.解读意义未明变异(VUS)需结合患者种族背景综合判断:亚裔人群特有突变不要直接判定无临床意义,可参考GP2多人群数据库重新评估致病风险。
➤4.分层开展遗传咨询,差异化告知风险:接诊德系犹太人,重点告知LRRK2、GBA1高携带风险;面对亚裔患者,侧重讲解隐性基因、东亚特有LRRK2突变的家系筛查必要性。
参考文献:
[1]Lange L, Fang Z, Makarious M et al.Parkinson's disease genetics across diverse ancestries: an observational genetic study of causal and risk variants with translational implications.The Lancet Neurology, 25, 741-754
责任编辑:老豆芽
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