北京
当主教和锻造者被迫穿梭时间线寻找失散的X战警，1997年的地球突然没了最强变种人守护者。两支来头不小的英雄团队同时浮出水面，还没等消灭外敌，自己先打成了一锅粥。
一边是曾在《X战警：动画系列》“冷慰”一集中登场的X因子，这个团队直接受美国政府调遣，满口民主监督那一套；另一边则是电索一手建立的黑箱行动组X特攻队，专门追猎天启和他的爪牙。漫画老粉都知道，这两拨人从页面上就互相看不顺眼，如今动画照搬了这对冤家，硬是让变种人圈子复刻了一把复仇者联盟式的内战。
第二季第二集刚开场，X因子和X特攻队就急不可耐地撞在一起。超级英雄见面的规矩从来都是先打一架再说，这次倒给了一个听起来很严肃的理由：问责制。X因子坚信民主监督和问责，想靠这套逻辑修复变种人与人类的关系，证明双方能并肩作战。电索则是使命大过天的人，在他眼里什么监管都得靠边站，任务第一。
这一轮，动画基本站到了X特攻队那边。片头字幕给了后者排面，反观X因子管理的牢房却野蛮得令人不适——几个变种青少年脖子套着类似基诺沙式的抑制项圈，被不明不白地关押着。欢欢一眼就看穿了X因子的底色，三言两语说服了北极星，带着人来了场越狱。剧本走向显然铺垫了北极星对组织的质疑甚至倒戈。不过，电索那套哲学也没被完全捧上天，他杀人不眨眼，弥赛亚情结严重，槽点同样醒目。
更耐人寻味的是，X因子玩的这套囚禁加政治大赦的路数，简直是对当年《内战》里复仇者联盟的公开致敬。他们有自己的秘密监狱，只不过从一个神盾局的飞天母舰换到了另一个地方；只要变种人愿为官方出力，就能换来政治豁免。鉴于X特攻队的极端手段，X因子把他们当成优先铲除的目标，一点也不让人意外。
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