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小数点后四位全对上?NC期刊论文遭PubPeer密集质疑

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来源:市场资讯

(来源:Pubpeer)

一篇《自然》子刊论文引发的数据真实性争议

2021年,国际知名学术期刊《自然·通讯》发表了一篇题为“A functional motif of long noncoding RNA Nron against osteoporosis”的研究论文。该研究由多家机构合作完成,旨在探索长链非编码RNA Nron在骨质疏松中的作用机制,被认为具有重要的基础研究价值。


然而五年后,这篇论文突然成为学术讨论的焦点。


五条质疑,指向数据异常

2026年6月,一位署名“Amphiura duncani”的学者在学术评论平台Pubpeer上连续发文,指出该论文存在多项数据异常。

第一条质疑直指核心图表。质疑者发现,图2e和图7e中骨体积分数(BV/TV)数值的后四位小数完全相同。而这两组实验分别来自基因敲除模型和卵巢切除诱导的骨质疏松模型,属于完全独立的实验体系,涉及不同的动物和处理方式。


第二条质疑针对补充图5a的源数据。质疑者指出,Nron值所在列的三个数值完全相同,而生物重复实验通常存在5%至20%的变异系数,三个样本数值完全一致“极为不可能”。

第三条质疑范围更广。质疑者在补充图2f、2h、8b、9b、11c等多个图表中发现大量重复数值,既有同组内的重复,也有不同组间的重复。“在规范的动物体内生物学实验中,大量独立样本出现完全相同数值的统计概率趋近于零,”质疑者写道。

第四条质疑指出,补充图5c、8b、10b中存在大量数值仅整数部分不同,小数部分却完全相同的情况。


https://pubpeer.com/publications/4EA7B5BF7A58A80C8A72B7A5791EA3#0

第五条质疑最为尖锐。质疑者发现,多组数据之间存在固定的算术运算关系。例如,补充图5c中空白对照组和Nron过表达组的第三批实验数据,可以通过给第一批对应数据加上一个固定常数精确得出。补充图8b中,Vector对照组的第1、2个数值乘以固定常数2.25,就能得到NCM2处理组对应位置的数值。

作者回应:质疑源于不了解实验流程

面对这些质疑,论文通讯作者之一孙瑶迅速作出回应。

孙瑶表示,所有问题均已在原始数据记录中得到核实。对于图2e和图7e中BV/TV数值后几位相同的问题,作者解释称,这是由于所有测量值均通过ImageJ软件手动测量,再经Excel公式自动计算并保留九位小数,截断至六位小数后出现了巧合性的数字重叠。

对于qPCR数据中数值完全一致的问题,作者解释这是两次归一化操作的结果。三次独立实验中,每组数据先经过一次归一化,整合时又进行了第二次归一化,导致特定组别数值完全一致。

对于微CT数据中出现的固定加减关系,作者承认这确实是系统性误差所致。“微CT扫描、阈值分割、三维重建和定量分析本身存在系统误差,”作者在回应中写道,“在同一批次连续测量的样品中,仪器的光路、灰度阈值和分析模板保持不变,会导致所有样品产生恒定的偏移。”

学术界的正常讨论还是需要警惕的信号?

这场争论在学术圈内引发了不同反应。有研究者认为,质疑者提出的问题相当专业,尤其是数据间存在固定算术关系这一发现,很难用“系统误差”完全解释。但也有学者表示,作者的解释在某些方面是合理的,特别是微CT这类仪器产生的离散数据,确实可能出现重复值。

截至目前,《自然·通讯》期刊尚未就此发表正式声明。孙瑶在回应结尾表示:“欢迎公众监督,也欢迎深入的学术讨论。如果有任何疑问,请随时联系通讯作者,我们将及时提供答复和解释。”

这场围绕一篇五年前论文的争论,再次提醒学术界:科研数据的透明性和可重复性,始终是科学共同体的基石。无论最终结论如何,这种公开质疑与回应的过程本身,正是学术自我纠错机制的体现。

https://pubpeer.com/publications/4EA7B5BF7A58A80C8A72B7A5791EA3#0

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