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西湖大学董晨院士团队鉴定CD4⁺T细胞新亚群——ThK细胞

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题图 | Pixabay

CD4⁺ T 细胞是适应性免疫系统的“核心指挥官”,传统上根据其特异表达的细胞因子和功能被划分为 Th1、Th2、Th17 和 Tfh 等经典亚群,每个亚群都有专属的核心转录因子,介导不同类型的免疫应答。颗粒酶家族蛋白此前主要发现于具有杀伤功能的免疫细胞中,其中颗粒酶 K(GZMK)在 CD4⁺ T 细胞中的表达缺乏系统鉴定。

2026 年 4 月 2 日,西湖大学医学院董晨院士团队在Nature Immunology期刊发表了题为:A unique CD4⁺ T cell subset expressing granzyme K is regulated by transcription factor EOMES and important for T cell-mediated intestinal inflammation 的研究成果。

研究鉴定出一种以高表达颗粒酶K为特征的新型 CD4⁺ 辅助 T 细胞亚群——ThK 细胞,并系统揭示了其由转录因子EOMES调控的特异机制及其在肠道炎症中的关键作用。这一发现不仅丰富了 CD4⁺ T 细胞的功能分类体系,还为炎症性肠病等慢性炎症疾病的免疫治疗提供了新思路。

图源:论文截图

为探究肠道炎症中 CD4⁺ T 细胞的异质性,研究团队首先对炎症性肠病(包括溃疡性结肠炎、克罗恩病)患者与健康人群的单细胞 RNA 测序公开数据进行了分析,发现了一群“与众不同”的 CD4⁺ T 细胞。这类细胞高表达 GZMK,但不伴随 Th1、Th2、Th17、Tfh 和 Treg 等经典亚群特征标记的高表达,也不与另一类颗粒酶 GZMB 明显共表达,拥有独特的分子“身份标识”。对溃疡性结肠炎患者黏膜活检样本的分析进一步证实,疾病活动期患者肠道黏膜中 GZMK 表达量显著升高,提示该细胞群体可能与肠道炎症密切相关。值得关注的是,在人类泛癌(pan-cancer)单细胞数据中,同样能检测到这类高表达 GZMK 的 CD4⁺ T 细胞,表明它并非肠道炎症专属,而是在炎症、肿瘤等多种病理环境中广泛存在的细胞群体。

为弄清该细胞的真实“面目”,研究团队借助小鼠 T 细胞诱导性结肠炎模型,对这群高表达 Gzmk 的 CD4⁺ T 细胞进行了全面的体内功能和特征分析。实验发现,高表达 Gzmk 的 CD4⁺ T 细胞在健康小鼠结肠中十分罕见,但在结肠发生炎症时会大量产生;同时,它几乎不表达 T-bet、GATA3、RORγt、BCL6、FOXP3 等经典 CD4⁺ T 细胞亚群的关键转录因子,进一步证明其独特性。基于此,研究团队将这群高表达 Gzmk 的 CD4⁺ T 细胞命名为——ThK 细胞。

更重要的是,ThK 细胞的分化独立于经典路径。研究证实,敲除 Th1 分化的关键转录因子 Tbx21(编码 T-bet)、Th2 的关键转录因子 Stat6 均不会削弱 ThK 细胞的产生;而敲除 Th17 的关键转录因子 Rorc(编码 RORγt)反而会促进 ThK 细胞的分化。此外,ThK 细胞与之前报道的 CD4⁺ CD8α⁺ 细胞毒性T细胞在表达特征和调控机制上存在显著差异,显示出其独特的生物学特性。

研究团队进一步锁定了 ThK 细胞的“核心开关”——转录因子EOMES。研究发现,Eomes 是 ThK 细胞中显著高表达的基因,且在人和小鼠的 CD4⁺ T 细胞中,Eomes 与 Gzmk 均呈现高度共表达。表观遗传学分析显示,ThK 细胞具有独特的染色质开放状态,Eomes 基因的启动子和增强子区域在ThK细胞中高度开放,其结合基序(motif)也在 ThK 细胞的染色质差异可及区域中显著富集。

进一步实验确认,EOMES 对 ThK 细胞的分化兼具充分性和必要性:体外过表达 EOMES 即可驱动 CD4⁺ T 细胞激活 Gzmk、Prf1 等 ThK 细胞核心基因的表达,形成 ThK 转录程序;而在小鼠体内特异性敲除 CD4⁺ T 细胞中的 Eomes,则可阻断 ThK 细胞的产生,并显著下调相关特征基因的表达。CUT&Tag 实验证实,EOMES 可直接结合 Gzmk、Prf1 等基因的调控区域,激活其转录。此外,EOMES 还能通过抑制 Tbx21、Gata3、Rorc 等基因的表达,限制 CD4⁺ T 细胞向其他经典亚群分化,从而维持 ThK 细胞的独特身份。

功能实验进一步揭示了 ThK 细胞是驱动肠道炎症的关键效应细胞。在小鼠结肠炎模型中,通过敲除 Eomes 阻断 ThK 细胞产生后,小鼠的肠道炎症显著缓解。研究还发现,ThK 细胞的核心转录程序具有高度的物种保守性和疾病普适性,在人和小鼠的多种疾病模型(包括自身免疫病、病毒感染和肿瘤)中均能检测到该细胞群体,且核心特征基因高度保守。

综上,这项研究明确了ThK 细胞是一个新型 CD4⁺ T 细胞亚群,系统阐明了EOMES是其核心转录因子,证实了其在肠道炎症中的关键致病作用,并揭示了该细胞在多种病理环境中的广泛存在。这一发现不仅进一步丰富了 CD4⁺ T 细胞功能亚群的分类体系,也为慢性炎症性疾病治疗提供了新的潜在靶点,为开发精准免疫干预策略奠定重要基础。

论文链接:

https://www.nature.com/articles/s41590-026-02479-6

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