第52卷 第1期
作者:同海欣;汤旭升;梁鹏;尚林东;赵志伟;李备;
作者单位:1.中国科学院长春光学精密机械与物理研究所 2.中国科学院大学 3.应用光学国家重点实验室 4.中国科学院光学系统先进制造技术重点实验室 5.长春长光辰英生物科学仪器有限公司
摘要:
为解决微生物菌落培养研究中菌落挑取、培养、鉴定工作量大、重复度高的问题,提出一种基于光学成像的菌落去重复挑选策略。通过宏观成像对菌落进行计数和定位,与通过微观成像获取的菌落特征信息结合,并使用贪心算法对获得特征信息的菌落进行挑选,实现菌落挑选的去重复工作。该方法成功建立了多维度菌落识别方法与技术路线,将200个菌落样本的挑选方案的获得缩减至5 min内,且当挑菌数与菌落样本种数之比为3时,菌落覆盖率超过90%。与传统的人工去重复和连续稀释法进行菌株挑选相比,基于光学成像的菌落挑选策略能够提高菌落挑选效率,降低人力资源成本,并有效提高挑菌的覆盖率。
关键词:
菌落; 去重复挑选; 光学成像; 挑选覆盖率;
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