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中国科学院微生物研究所
张寿悦课题组
简介
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张寿悦,中国科学院微生物研究所研究员,博士生导师,国家微生物科学数据中心首席科学家,微生物多样性与资源创新利用全国重点实验室研究员。入选中国科学院人才计划、北京市科技新星、北京生物结构前沿中心卓越学者。作为项目负责人,主持国家科技部重点研发计划项目,基金委重大研究计划培育项目、面上项目等。以第一/通讯(含共同)在Nature、Science、Cell、Molecular Cell、Cell Research和Nature Communications等期刊发表SCI论文21篇。申请/授权发明专利5项。
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实验室照片墙
研究方向
课题组主要从事微生物大数据集成和挖掘的方法研究,运用人工智能方法挖掘微生物基因组大数据中功能蛋白和RNA元件,解码大分子进化规律,建立“数据-模型-设计-构建”于一体的生物制造元件与细胞工厂创新研发体系,发现微生物新分子系统,从而开发基因编辑工具与合成生物学催化元件。致力于发展从新功能元件发现、理性设计到最终高效细胞工厂构建的新方法,为生物制造提供源头核心技术与元件储备。
方向一:基因编辑工具和合成生物学催化元件的深度挖掘与设计
聚焦生物制造中两类关键元件——基因编辑工具与生物催化元件的源头创新。我们致力于通过整合微生物多组学数据与蛋白质结构信息,系统挖掘自然界中未被充分利用的新型核酸酶系统与高性能催化酶。在此基础上,开发基于三维结构进化规律与深度学习的人工智能设计方法,实现对基因编辑工具的功能增强、特异性提升,以及对催化元件的活性优化、底物谱拓展乃至全新功能的理性设计。该研究将突破传统依赖经验试错的元件开发模式,形成“数据驱动挖掘、智能指导设计”的新范式,为微生物遗传改造与高效细胞工厂构建提供新一代底层工具与核心催化部件。
方向二:基于多模态人工智能模型的元件互作研究与细胞工厂构建
致力于解决生物制造中从元件到系统的集成挑战,重点突破元件功能与细胞底盘适配性的关键瓶颈。通过整合基因组、转录组、代谢组等多模态数据,构建能够模拟微生物生理状态的“虚拟微生物”人工智能模型,系统解析代谢网络中各类元件的协同互作机制与调控规律。该研究将建立从元件功能预测到系统性能优化的全新研发范式,实现高效微生物细胞工厂的理性设计与性能提升。
招聘需求
1.具有以下相关研究背景者优先:
(1)计算与数据科学人才:掌握人工智能、生物信息学、大数据分析等技术。
(2)分子生物学研究人才:掌握细胞基因编辑验证、分子克隆、蛋白质表达与纯化等分子生物学技能,或具备单颗粒冷冻电子显微镜技术相关样品制备、数据收集与计算经验。
(3)合成生物学研究人才:掌握蛋白质表达与纯化、酶动力学分析、代谢途径构建与优化等酶工程与代谢工程核心技能,具备微生物遗传操作与发酵优化经验。
2.在国际期刊发表过具有影响力的研究成果者优先。
3.具有独立的课题研究能力、较强的中英文写作能力、合作精神、强烈的内驱力。
4.身体健康,性格开朗,全职在站工作。
岗位与薪资待遇
1.特别研究助理(博士后)2名
已经获得或即将获得博士学位(已获得博士学位不超过3年),年龄不超过35周岁(含);根据个人能力和具体情况,采用一事一议的形式。具体可参见中国科学院微生物研究所和国家有关规定:https://www.im.cas.cn/rczp/bshzp/
2.联合培养博士1名
东北林业大学2026年与中国科学院微生物研究所联合培养专项计划博士研究生,联合培养的博士生第0.5学年在东北林业大学进行课程学习,自第0.5学年起到北京微生物所进行联合培养。具体可参见招生简章:
https://yz.nefu.edu.cn/info/1028/3650.htm。
3.助理研究员(正式编制)1名
博士后出站人员或博士毕业后具有三年及以上研究工作经历人员;工资及福利待遇按中国科学院微生物研究所和国家有关规定执行。
申请方式
请将上述材料按照以下任一方式进行投递,所有材料将严格保密,我们将尽快联系通过初审的候选人安排面试。
投递简历请选择:中国科学院微生物研究所张寿悦课题组
简历投递方式(可选任一):
1. 扫描二维码投递简历;
3. 点击链接投递简历:https://data.bioart.com.cn/f/p0EB2y(复制链接至浏览器投递简历)
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制版人:半夏
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