早期筛查是提高癌症治疗效果和生存率的一个有效措施。目前在全球范围内,仅有少数几种恶性肿瘤(结直肠癌、乳腺癌、宫颈癌、肺癌)拥有标准的筛查方法,覆盖人群十分有限。基于液体活检的MCED依托多种前沿技术,如基因甲基化检测、基因突变特征检测、基因片段化特征检测等,仅需采集患者适量体液样本,即可同时对多种癌症进行检测,具有广阔的应用前景。
目前,MCED检测Galleri在美国作为LDT用于临床,该检测基于外周血循环中cfDNA的靶向甲基化测序,结合机器学习算法来检测癌症特异性DNA甲基化模式,并预测癌症起源(CSO)。该检测在CCGA研究和PATHFINDER研究中得到了开发和验证,并在不同种族和民族群体中显示出相似的性能。Galleri适用于癌症风险较高的个体,如50岁及以上的人群,其阳性预测值(PPV)为43.1%,高于针对无症状、高风险人群的单一癌症筛查。
近日,美国印第安纳州社区健康网络、Ochsner癌症研究所、Vincere癌症中心联合GRAIL公司等团队,基于111,080名个体(中位年龄58岁)评估了Galleri在真实世界中的表现,分享了真实数据和临床经验。数据显示,Galleri的癌症检出率为0.91%(1011/111,080),与临床研究及独立模型值一致。在1011例检测到癌症的患者中,有459例提供了临床结果,其中258例确诊为侵袭性癌症,涵盖32种癌症类型。Galleri在87%的已报告癌症类型病例中正确预测了CSO,与既有临床研究结果一致。CSO的预测使大多数患者能有效完成检查,从收到结果到癌症诊断的中位时间为39.5天。
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主要研究内容
Galleri检测结果
研究报告了在2021年至2023年收集的111,080项Galleri检测的真实数据,其44%为女性,56%为男性,中位年龄均为58岁(图1)。在该真实人群中,Galleri的总体癌症检出率(CSDR)为0.91%,女性个体的CSDR为0.82%,男性个体的CSDR略高为0.98%(图1C)。(CSDR是指MCED检测阳性在所有MCED检测中所占的比例。)
同时,Galleri可通过识别特定于器官、组织或细胞系的cfDNA甲基化模式来预测CSO,以帮助指导MCED检测阳性结果后的诊断工作。研究显示,Galleri对常见癌症,如淋巴系癌、结直肠癌、乳腺癌、肺癌和前列腺癌的预测频率更高,对不常见的宫颈癌、肛门癌、肾癌、膀胱癌和卵巢癌的预测频率较低(图1D)。MCED人口统计学模型也预测了CSO分布,总体上与获得的CSO分布结果相符。女性和男性个体的CSO分布大致相似,性别相关的癌症存在一些差异。
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图1.真实世界人群中的特征数据及MCED结果(N=111,080)
经验PPV和诊断时间
研究分析了459例Galleri检测阳性患者的结果数据,11%(48/459)在数据收集时等待进一步的诊断检查(图2A)。在完成诊断评估的其余411名患者中,63%(258/411)被诊断为浸润性癌症。在Galleri检测时,259例患者未报告有癌症相关症状,其中128例患者最终被诊断为癌症,经验PPV为49.4%(128/259)。有诊断日期的无症状患者(n = 115)到诊断的中位时间为43天。
虽然Galleri检测是预期用于无症状患者,但医疗机构选择将其用于有癌症相关症状或活动性癌症的个体。据悉,71名患者在检测时出现了癌症相关症状,但没有诊断出活动性癌症。在这些有症状的患者中,53人最终被诊断为癌症,经验PPV为74.6% (53/71)。有可用诊断日期的患者(n = 47)中位诊断时间为30天。在这两个人群中,经验PPV在性别和年龄方面没有太大差异(表1)。综合无症状和有症状患者,共有181例患者被诊断为新发浸润性肿瘤或癌症复发,中位诊断时间为39.5天。除了这些新癌症诊断案例外,还有一部分Galleri检测呈阳性的病例,这些患者都是由专门为已确诊患有活动性癌症的患者安排MCED检测的医疗机构所检测的(图2A)。
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图2.Galleri检测呈阳性后报告的临床结果。
癌症类型和分期
在258例Galleri检测阳性的癌症患者中,有268例被诊断为癌症,其中10例多发原发癌症。在237名患者中,共有247例癌症可以基于临床数据确定类型(图2B)。数据表明,在真实世界中,检测到多种不同癌症类型(图3),大多数确诊的癌症(74%)没有推荐的A/b级筛查(即乳腺癌、结直肠癌、宫颈癌或肺癌以外的癌症类型)。
来自122名患者的124例癌症报告了癌症分期信息(图2C),分别有18%、10%、24%和48%在I期、II期、III期和IV期被检测到。Galleri检测到的I/II期癌症包括肛门癌、结直肠癌、子宫癌、癌肉瘤、食道癌、外分泌胰腺癌、霍奇金和非霍奇金淋巴瘤、HPV引起的口咽癌、肾癌、肝癌、肺癌、口腔癌、浆细胞骨髓瘤和浆细胞疾病、前列腺。
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图3.通过Galleri检测发现的癌症病例
癌症起源预测
在237例获诊断和报告癌症类型的患者中,Galleri预测的CSO与癌症诊断相匹配的比例为87%(207/237)(图4A)。对于65岁或以上的患者亚群,预测CSO的准确性相似(85%[135/158])。不正确的CSO预测稀疏地分布在预测的CSO范围内。在至少10个独立患者预测中,Galleri的预测CSO准确性范围在82%-97%(图4B),与此前的临床研究结果一致。
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图4.真实世界Galleri预测CSO的准确性与已有独立临床研究结果一致。
结语
研究团队分享了Galleri在真实世界中的应用数据,评估了其在临床实践中的表现。Galleri成功检测了各种高死亡率或高发病率癌症的癌症信号,包括早期阶段(I和II)的病例。Galleri在预测真实世界的CSO(87%)方面具有很高的准确性,诊断时间(中位39.5天)比PATHFINDER研究中观察到的时间(79天)短,证明了Galleri的CSO预测在促进快速诊断方面的潜在价值。除了较高的CSO精度外,经验PPV也与以往的研究一致。
该研究的一个关键优势是分析了Galleri的性能和在超过10万人的真实世界人群中的表现。重要的是,研究人员可以将这些真实世界数据与已报道的临床研究结果进行比较,以评估该检测的稳健性和普遍性。总的来说,这一真实世界的研究经验强调了MCED检测扩大可检测癌症范围的同时,在临床实践中与现有推荐的筛查方案相结合时保持低假阳性率的潜力。在实际应用中,对MCED检测性能的持续稳健和广泛监测将支持其进一步改进。未来,Galleri可能会通过将真实世界的数据纳入机器学习算法的训练中来改进。
原文信息:
Matrana, M., Shukla, V., Kingsbury, D. et al. Real-world data and clinical experience from over 100,000 multi-cancer early detection tests. Nat Commun 16, 9625 (2025). https://doi.org/10.1038/s41467-025-64094-7
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