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产品名称:CAS号:156312-20-8,YOYO-3的核心特性与化学结构
1. 核心特性与化学结构
分子基础:YOYO-3(CAS 156312-20-8)是一种碳菁二聚体荧光染料,分子式为C₅₃H₆₂I₄N₆O₂,分子量1322.73。其结构由两个碘化苯并噁唑环通过柔性链连接,形成双阳离子对称结构,赋予其高亲和力与荧光增强特性。
荧光特性:激发波长612 nm,发射波长631 nm(远红荧光),消光系数167,000 cm⁻¹M⁻¹(结合DNA后),量子产率0.15。游离状态下荧光极弱,结合双链DNA(dsDNA)后荧光增强100-1000倍,实现“荧光开关”效应,背景信号极低。
2. 反应机制与特异性
双插入作用:通过两个荧光团嵌入DNA双链的相邻碱基对,优先结合富含AT的区域(如5'-CTAG-3'序列),并引起局部DNA结构扭曲(螺旋展开约106°)。
静电相互作用:带正电荷的侧链与DNA磷酸骨架的负电荷结合,增强稳定性。
序列偏好性:对双链DNA(dsDNA)高度特异性,对单链核酸结合能力弱,确保精准标记。
非共价结合:无需化学修饰,通过物理嵌入实现标记,操作简便且对生物分子活性影响小。
3. 生物医学应用场景
死细胞与核酸标记:因无细胞膜穿透性,仅标记死细胞或固定细胞的核酸,用于活/死细胞区分、细胞核染色及染色体结构观察。
流式细胞术与显微成像:用于DNA含量分析(如细胞周期检测)、荧光显微镜下的细胞核成像及核酸动态追踪,适配Cy5滤光片组。
凝胶电泳与定量分析:替代溴化乙锭(EtBr),用于DNA/RNA片段可视化及低浓度核酸定量(检测限达皮克级)。
多色标记与复染:远红荧光特性避免与绿色/红色染料光谱重叠,适用于多参数成像及FISH(荧光原位杂交)等实验。
药物递送与纳米材料:偶联抗体、药物或纳米颗粒,构建靶向递送系统,增强肿瘤细胞特异性摄取。
4. 操作优化与储存
储存条件:-20℃避光干燥保存,避免反复冻融;分装后长期保存可添加甘油(50%终浓度)于-80℃。
使用浓度:推荐1-10 μM,与DNA质量比例1:5-10碱基对,使用前需稀释至工作浓度(如HHBS、PBS缓冲液)。
纯化与验证:反应后通过HPLC或凝胶过滤去除游离染料,确保标记效率≥95%;通过流式细胞术或荧光光谱仪验证标记效果。
安全注意事项:佩戴防护手套/眼镜,避免直接接触皮肤/眼睛;仅限科研使用,禁止人体实验。
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