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华大智造T1+助力多地疾控破译病毒全貌

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世界卫生组织专家在7月22日就蚊媒传播疾病基孔肯雅热发出警报,提醒各国做好应对准备,避免疫情大规模暴发。基孔肯雅热多为轻症,大部分患者可在1—2周之内自行恢复。防范的关键在于防蚊灭蚊、锁定源头、控制传播。

第一时间确认输入病例来源,能够支持疾控、海关等相关部门快速、精准、有效地制定防控策略,守护市民健康。

在此轮基孔肯雅热疫情中,相关地区的疾控中心、海关紧急响应,均使用华大智造(688114)全读长(SEQALL)系列测序平台进行基孔肯雅病毒测序,其中华大智造最新款DNBSEQ基因测序仪T1+为多地疾控提供硬核支撑,成功破译此轮病例样本基孔肯雅病毒全貌,实现精准溯源。

深圳疾控—华大智造联合实验室基于华大智造T1+基因测序仪,对4例基孔肯雅病毒感染者进行测序溯源,其测序覆盖度均高于99.9%。除深圳疾控之外,T1+助力完成的基孔肯雅病毒溯源报告在各地疾控陆续输出,高效捕获病毒序列,支持疾控部门快速、精准、有效地制定防控策略。

作为全球日生产速度最快的桌面式Tb级测序仪,T1+凭借快速、高通量的优势,针对低载量、型别多样的病毒阳性样本,无需培养直接进行宏基因组测序均可获得完整全长。T1+也是全球首款可在24小时内产出Tb级别数据的桌面式测序仪,具备24小时Tb级数据产出、一键自动化操作等优势,集成DNB制备与生信分析模块,实现“测序—分析一体化”全流程闭环,可在24小时内一键完成DNA文库的PE150测序任务,完成SE50测序最多只需7小时。

T1+针对病原微生物的自动化交付全流程方案能够为传染性疾病防控提供强有力的工具支撑,从样本提取、文库制备,再到结合DNB制备分lane加载系统,最终完成测序并在测序仪内自动生成生信分析报告,全程自动化解放双手,可全面满足公共卫生领域对“精准、快速、简易”的核心需求。

目前,多地海关正应用CycloneSEQ平台开展基孔肯雅病毒全基因组测序,从源头管控输入性病例。数据显示,采用CycloneSEQ平台G100-ER进行测序,其测序结果覆盖度可达100%,与采用DNBSEQ平台测序结果完全一致。凭借纳米孔测序技术实时快速的优势,CycloneSEQ测序平台可对海关入境时在流行态下的高密度样本实现监测,高效识别传染源,抢占先机。若传染源发生一定程度暴发,T1+等DNBSEQ测序平台则可支持大规模样本测序、调查和溯源监测变异。

作为全球首个、国内唯一同时拥有大规模商业量产级短读长(DNBSEQ)与长读长(CycloneSEQ)测序产品的企业,华大智造可为病原微生物的监测与防控同时提供短读长和长读长的测序方案,充分满足不同场景的需求。

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