浙江
来源：丁香科研
作为医学科研人，可能每天都需要找我们研究的蛋白互作创新靶标，以进一步探讨其互作后发挥的生物功能。因此，应用现有的在线蛋白互作信息可视化工具为我们的科学研究助力成为必备的需求。那么接下来，笔者就带领大家一起来盘点最新的蛋白质互作信息在线工具：
一、STRING数据库
链接: https://string-db.org
该数据是目前最常用的蛋白互作预测及可视化在线工具之一，支持多种格式输入，包括基因名、UniProt ID 或序列；其整合了大量的实验数据、数据库注释、共表达及计算预测，覆盖多物种（人类、小鼠等）。目前已经超过 2 千亿互作信息。
示例：STRING 数据库 TP53 互作蛋白预测及可视化（注：无特别说明，本例中图例均来自 STING.db 数据网站截图）
1.进入网站后点击「搜索」（Search）按钮
2.在输入栏输入「TP53」，然后选择物种「Homo sapiens」，点击「搜索」（Search）
3.进入一般确认输入的信息，然后按「继续」（Continue）
4.即可出现互作网络图
5.在网络图下方按钮，可以根据自己要求设置，包括「设置」、「分析」、「输出」等功能，最后得到自己满意的结果
二、BioGRID 数据库
链接: https://thebiogrid.org
本数据库基于实验验证的互作数据库，包括蛋白、化合物和遗传相关相互作用。数据支持批量下载及 API 调用。
示例：BioGRID 数据库 TP53 互作蛋白预测及可视化（注：无特别说明，本例中图例均来自 BioGRID 数据网站截图）
1.进入网站，输入框输入「TP53」，选择物质「Homo Sapiens」,然后点击「提交」（Submit）
2.即可查看 TP53 蛋白互作情况信息
3.点击「网络」（Network）按钮，即可出现网络互作可视化图
三、IntAct 数据库
链接： https://www.ebi.ac.uk/intact
该数据库为欧洲生物信息网络中心数据库（EMBL-EBI），为开源互作数据库，包含多物种互作数据及实验方法注释。同时也支持多种数据格式导出（PSI-MI, MITAB）。
示例：IntAct 数据库 TP53 互作蛋白预测及可视化（注：无特别说明，本例中图例均来自 IntAct 数据库网站截图）
1.进入网站，输入框输入「TP53」，点击「搜索」按钮
2.进入结果后，勾选所需物种类型
3.即可看到筛选结果，根据筛选指标来框定最终输出结果
四、HIPPIE 数据库
链接: https://cbdm-01.zdv.uni-mainz.de/~mschaefer/hippie/information.php
该数据库为人类蛋白质互作预测，整合多数据库及实验证据置信评分；可自定义筛选条件，提供动态网络与功能聚类。但该数据库目前最新更新数据仅到 2022 年 4 月。
示例：HIPPIE 数据库 TP53 互作蛋白预测及可视化（注：无特别说明，本例中图例均来自 HIPPIE 数据库网站截图）
1.进入数据库，点击「蛋白质查询」，然后在输入框输入「TP53」
2.得到筛选结果，可以根据评分进行进一步筛选，然后导出数据
五、PSICQUIC 数据库
链接: https://www.ebi.ac.uk/Tools/webservices/psicquic/view
该数据为跨数据库检索工具，整合 50 + 蛋白质互作资源，统一接口快速查询，支持自定义数据源（如DIP、MINT），同样隶属于欧洲生物信息网络中心数据库（EMBL-EBI）。
示例：PSICQUIC 数据库 TP53 互作蛋白预测及可视化（注：无特别说明，本例中图例均来自 PSICQUIC 数据库网站截图）
1.进入数据库，点击「蛋白质查询」，然后在输入框输入「TP53」
2.可以根据自己需求，点击下列数据库结果查看
3.比如点击「BioGrid」，即可看到旗下的结果，并能了解互作监测方法，然后根据自己需求下载数据
今天的介绍就到这里啦，通过本示例数据，想必你已经对这几个蛋白质互作在线工具有了一定的了解了，赶紧开启你自己研究的目标蛋白互作信息查询，助力你的科研吧！
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