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《自然-医学》:检出率高达84.8%!吴一龙团队研究:预测肺癌脑转移患者生存期,有望指导临床治疗选择

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非小细胞肺癌(NSCLC)是肺癌中最常见的类型,而中枢神经系统(CNS)转移(包括脑转移和脑膜转移)是NSCLC患者常见的并发症之一,其治疗也面临巨大挑战。由于脑瘤样本的稀缺性以及获取过程的风险性,我们对CNS转移中的独特分子特征和生物标志物的了解仍然有限。传统组织活检存在侵入性高、难以实时监测等局限,而液体活检技术的应用为解决这一难题提供了新手段。在既往研究中,脑脊液循环肿瘤DNA(ctDNA)已被证实在脑膜转移的诊断和CNS肿瘤的分子特征分析方面优于血浆ctDNA。然而,关于脑脊液ctDNA在CNS转移中的临床应用潜力,仍有许多问题亟待解决。

近日,由广东省肺癌研究所、广东省人民医院吴一龙教授领衔的一项研究结果在《自然-医学》(Nature Medicine)发表。结果显示,在NSCLC患者中,脑脊液ctDNA在反映CNS转移肿瘤负荷及作为独立预后生物标志物方面具有显著的临床价值。在脑膜转移患者中,ctDNA检出率高达84.8%,脑转移患者的检出率则为46.2%。在不同治疗背景下,以及在不同转移情况的患者中,ctDNA阳性都与更短的总生存期(OS)有关

此外,结合临床特征与脑脊液ctDNA检测结果,可以更精准地预测患者生存风险。而基于脑脊液检测到的突变进行匹配治疗及纵向监测疾病进展,能更好指导治疗策略的选择,为患者带来显著的生存获益。

文章指出,这些发现强调了将脑脊液ctDNA检测纳入常规临床实践及未来临床试验的价值


截图来源:The Nature Medicine

该队列研究纳入了584例合并CNS转移的NSCLC患者(脑转移229例,脑膜转移341例,疑似脑膜转移1例),共采集了779份脑脊液样本和302份配对肿瘤组织样本,对其进行全面的DNA分析,并结合患者的临床病理学、影像学及长期随访数据,以评估脑脊液ctDNA动态监测的临床应用价值。

脑脊液ctDNA检测结果发现,在584例患者中,阳性396例,阴性188例(研究团队将检测出ctDNA定义为至少发现一种肿瘤衍生的基因变异[体细胞数目变异或拷贝数变异])。分析结果显示:分析结果从多个维度支持了ctDNA的预后和指导治疗价值

脑脊液ctDNA反映脑转移肿瘤负荷

  • 多种因素是脑脊液ctDNA阳性的独立预测因素,主要预测因素包括脑脊液细胞学阳性、脑膜转移诊断和既往接受过两次及以上治疗。

  • 在脑膜转移患者中,ctDNA检出率高达84.8%,且与脑脊液肿瘤细胞阳性率显著相关。

  • 在脑转移患者中,ctDNA检出率为46.2%;与脑转移病灶数<5个或仅存在非靶向病灶的患者相比,具有≥5个可评估脑转移病灶患者的ctDNA检出率明显更高(64.7% vs 33.3%);ctDNA阳性组患者的脑病变最长总直径显著高于阴性组(698.9 mm² vs 357.8 mm²),且ctDNA最大变异等位基因频率与肿瘤大小呈正相关

脑脊液ctDNA可作为独立预后因素

  • ctDNA阳性患者的中位OS明显短于ctDNA阴性患者(11.1个月 vs 21.4个月,HR 1.9,95% CI 1.56–2.39,P<0.0001)。

  • 在不同治疗背景下均得到了类似的结果。其中,在初治亚组中,ctDNA阳性和ctDNA阴性患者的中位OS分别为19个月和30.4个月;在经治亚组中,上述两组患者的该指标分别为9.4个月和20.2个月;在脑膜转移亚组中,则分别为10个月和17.4个月;在脑转移亚组中,则分别为13.8个月和25.8个月。

  • 多变量模型分析显示,ctDNA阳性、体能状态不佳、脑脊液细胞学阳性、更大的肿瘤转移负荷与疾病进展,都与较差的OS相关。对各个因素逐一重复分析的结果支持脑脊液ctDNA可作为独立预后因素。

脑脊液ctDNA在脑转移和脑膜转移患者风险分层中的作用

  • 在可进行欧洲神经肿瘤学协会和欧洲内科肿瘤学会(EANO-ESMO)脑膜转移亚型分级的310例患者中,I型(依据脑脊液细胞学或活检阳性来诊断)组的脑脊液ctDNA检出率明显高于II型(仅依据临床表现和神经影像学来诊断)组(90.4% vs 73.8%,P=0.0002),但EANO-ESMO脑膜转移亚型分级并未预测患者的生存期。脑脊液ctDNA阳性与中位OS更低显著相关(10个月 vs 18.1个月,HR 1.95,95% CI 1.32–2.88,P =0.0006)。

  • 在新诊断的61例脑转移患者中,脑脊液ctDNA是一个重要的预后因素,脑脊液ctDNA阳性患者的中位OS为17.5个月,而脑脊液ctDNA阴性患者则为41.2个月(HR 2.11,95% CI 1.07–4.18,P=0.03)。

脑脊液ctDNA可识别高风险脑膜转移患者

  • 在脑脊液细胞学阳性的脑膜转移患者中,脑脊液ctDNA阴性患者的中位OS明显长于脑脊液ctDNA阳性患者,分别为19.4个月和10.8个月。

  • 对于通过脑磁共振成像(MRI)和脑脊液细胞学检查诊断为仅脑转移的患者中,有34例在长期随访后出现了脑膜转移。脑脊液ctDNA阳性的患者在2年随访期间进展为脑膜转移的比例,显著高于脑脊液ctDNA阴性的患者(48.5% vs 23.5%)。

脑脊液ctDNA显示具有独立预后价值的特异性DNA特征

  • 脑脊液ctDNA识别出88.1%的患者存在驱动基因突变,包括EGFR(76.8%)、ALK(6.8%)、ERBB2(2.8%)和ROS1(1.3%)等基因类型。在亚洲人群中,脑脊液ctDNA与脑转移瘤DNA特征高度一致。

  • 302例患者提供了配对的肿瘤样本。通过对所有配对样本(无论活检器官如何或是否有治疗史)分析后发现,脑脊液ctDNA与肿瘤组织之间的相关性增强,这表明脑脊液中特异性DNA特征可能受到临床因素及肿瘤内在特征的影响

  • 68.3%的患者在脑脊液中检测到特异性突变或拷贝数变异(CNVs),这些变异在肿瘤测序中并未发现,主要存在于RTK/RAS、PI3K、细胞周期和转化生长因子β(TGFβ)通路中。

  • 脑脊液特异性基因突变与更差的中位OS相关(9.9个月 vs 15.3个月,HR 1.64, 95% CI 1.15–2.32, P=0.006)。多变量分析显示,脑脊液特异性基因突变是生存率降低的主要驱动因素。

脑脊液ctDNA预后模型显示出预后价值

  • 基于已知临床特征、脑脊液ctDNA检测结果和富集DNA的多种特征,研究团队开发了一个脑脊液ctDNA预后模型,纳入了5项独立指标,包括RB1突变、脑脊液ctDNA状态、东部肿瘤协作组(ECOG)评分、肿瘤转移负担及全身进展情况,并基于这些因素,将患者分为高风险组和低风险组。

  • 针对不同队列的分析结果显示,该模型在各队列中均能区分高风险与低风险患者,且低风险患者的OS都整体更长,这些结果支持该模型在NSCLC患者CNS转移风险分层中的潜在临床应用价值

脑脊液ctDNA对治疗的指导价值

  • 在536例携带基因突变可靶向治疗的患者中,有329例接受了靶向治疗,治疗方案基于脑脊液ctDNA检测到的分子靶点(207例)或仅基于组织分析(122例)的结果。

  • 在脑脊液ctDNA阳性且至少携带一个驱动基因突变的患者中,与其他系统性治疗相比,靶向治疗显著改善了中位OS(15个月 vs 8.6个月,P=0.003)。然而,对于脑脊液ctDNA阴性或ctDNA未检出驱动基因突变的患者,仅基于组织分析匹配的靶向治疗与其他治疗方案之间的中位OS差异较小(34.9个月 vs 16.8个月,P=0.05)。

  • 进一步分析发现,脑脊液ctDNA可用于识别从免疫检查点抑制剂(ICI)治疗中获益的患者。在脑脊液ctDNA阳性患者中,接受ICI治疗的患者中位OS显著优于接受其他系统性治疗的患者(17.4个月 vs 3.9个月,P=0.02)。而在脑脊液ctDNA阴性患者中,ICI治疗与其他治疗方案的中位OS并不存在明显差异(25.2个月 vs 21.4个月,P=0.6)。

  • 在294例携带驱动基因突变并接受酪氨酸激酶抑制剂(TKI)治疗的患者中,79例患者在脑脊液中检测到耐药突变。在这79例患者中,分别有24例和9例患者接受了针对靶向耐药和脱靶耐药突变的二线靶向治疗。接受匹配治疗的患者中位OS明显优于未接受匹配耐药突变的靶向治疗的患者(14.3个月 vs 6个月,P=0.018)。这表明在临床实践中,脑脊液ctDNA检测可作为CNS转移进展时组织活检的替代方法

  • 长期纵向分析显示,共122例患者接受了至少两次脑脊液ctDNA检测,结果显示其可以监测肿瘤进展过程,发现与CNS进展相关的驱动基因突变并指导后续治疗,这表明脑脊液ctDNA纵向动态监测在CNS疾病进展中具有潜在价值

总之,该研究表明,脑脊液ctDNA能反映CNS转移肿瘤负荷,并可作为独立的预后生物标志物,也可结合临床特征预测患者风险,且对治疗具有指导意义

参考资料:

[1]Zheng, MM., Zhou, Q., Chen, HJ. et al. Cerebrospinal fluid circulating tumor DNA profiling for risk stratification and matched treatment of central nervous system metastases. Nat Med (2025). https://doi.org/10.1038/s41591-025-03538-5

来源 | 医学新视点

撰文 | 药明康德内容团队

编辑 | 木白

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