简简单单硕博士毕业思路-中科院2区：网药+实验验证文章思路-多个信号通路联合验证，收藏！

【写在前面】：之前有分享过网药+实验验证的写作思路，今天以具体文章为例子~

思路：首先筛选中药的活性成分和靶点以及疾病靶点——取靶点的交集——构建草药-成分-靶点网络——PPI 分析——GO和KEGG分析——核心靶点和核心化合物分子对接——实验验证（动物模型-PCR、ELISA 和 Western blot 分析验证 肉豆蔻水提取物 的关键靶点和信号通路。单个通路验证-两个信号通路验证-多个通路联合验证）。下文是典型的多个信号通路联合的机制研究！

【文章题目】Myristica fragrans water extract modulates multiple biological processes to pre-protectanhydrous ethanol-induced gastric ulcers via Akt/JNK/Nrf2 pathway activation

肉豆蔻水提取物调节多种生物过程，通过 Akt/JNK/Nrf2 通路激活预保护无水乙醇诱导的胃溃疡

【摘要】

民族药理学意义：香肉豆蔻（肉豆蔻）是一种常用的中草药和可食用的香料。根据《中华人民共和国药典》，它具有中温、促气、肠涩、止泻的作用。在《本草纲目》的记载中，它是经常用于治疗胃肠道疾病的芳香肉豆蔻水提取物（MFWE）。

研究目的：本研究采用UHPLC-Q-Orbitrap-MS/MS方法研究香肉豆蔻治疗胃溃疡的药效学物质基础和分子机制。这可能为芳香肉豆蔻的临床应用提供理论指导，并为其未来发展为缓解急性胃溃疡的天然功能产品提供理论基础。

材料与方法：利用UHPLC/MS技术和网络药理学进行了鉴定可能的活性化学分子，筛选出核心靶点和核心途径，并通过分子对接情况模拟药物靶点结合。急性胃溃疡是由无水乙醇（0.075ml/10g）引起胃溃疡。芳香肉豆蔻水提取物（182 mg/kg和364 mg/kg）提前14天口服。采用相同的方法将0.5%羧甲基纤维素溶液分配到模型组和对照组。这些老鼠在第15天就被安乐死了。然后，取出胃组织以进行组织学分析。该组织需要检测IL-1β、TNF-α、IL-10和IL-6的水平，以及SOD、GSH-Px、MDA和MPO的活性。另外，采用H&E染色和TUNEL法观察其对小鼠胃黏膜的影响。采用Western blot检测细胞凋亡、铁死亡和抗氧化相关蛋白。

结果：利用UHPLC-Q-Orbitrap MS/MS和TCMSP数据库从MFWE中共鉴定出10种化学成分。通过对这些已鉴定成分的网络药理分析，发现其保护作用主要由六种化合物进行，即：肉豆蔻素、肉豆蔻碱、铁醛、脱氢二异丁香酚、7-甲氧基-4-甲基香豆素、1,5-Bis（(2,5-二甲氧基苯）戊烷-1,5-二酮。此外，研究发现MFWE可显著降低TNF-α、IL-1β和IL-6，增加IL-10，并减轻酒精性胃溃疡引起的炎症。可降低MDA和MPO，提高SOD和GSH-Px，缓解氧化应激。网络药理学结果表明，Akt、JNK和凋亡信号通路对MFWE治疗胃溃疡的作用至关重要。进一步的文献研究显示，Nrf2和铁死亡信号通路可能与MFWE的作用有关。分子生物学研究证实，MFWE降低了p-Akt/Akt、p-JNK/JNK、Bax和Keap-1的表达水平，提高了Bcl-2、Nrf2、HO-1、SLC7A11、GPX4、FTH1的表达水平。

结论：本研究表明MFWE可减轻炎症反应，减少细胞凋亡和铁死亡。它们通过激活Akt/JNK-Keap1-Nrf2-HO-1信号通路对胃溃疡具有保护作用，并提供了一种很有前途的治疗策略。

关键词：香肉豆蔻，UHPLC-Q-Orbitrap-MS/MS ，胃溃疡，网络药理学，细胞凋亡，铁死亡

【结果部分】

1.MFWE化学成分分析

2.MFWE对无水乙醇引起的胃溃疡损伤有保护作用

3.MFWE可减轻胃溃疡小鼠的氧化和抗氧化失衡的情况

4.MFWE可减轻胃溃疡小鼠炎症因子的表达

5.网络药理学分析结果

6.分子对接

7.MFWE可降低了胃粘膜细胞的凋亡水平

8.MFWE alleviates ferroptosis by activating Akt/JNK-Keap1-Nrf2-HO-1 pathway

9.MFWE对胃溃疡的保护分子机制

【结论与讨论】写作思路

首先是肉豆蔻水提取物中化合物治疗胃溃疡的物质基础；然后是网络药理学研究肉豆蔻水提取物治疗胃溃疡的机制，包括核心靶点和核心通路，以Apoptosis, MAPK signaling pathway, PI3K-AKT signaling pathway, JAK-STATsignaling pathway信号通路等的机制，结合已发表文章和实验结果进行论述。

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