天津
在北洋派分裂的同时，中国南方陷入了更为彻底的碎片化，政治动荡和战乱更甚于北方。南方各省山地较多，崎岖的地形本不利于统一，加之晚清各省分别编练新军，军事上互不统属。清朝覆灭之后，南方各省出现各自独立的倾向。袁世凯统治时期一度逆转了分裂趋势，但在洪宪帝制引发的战争中，国家统一被再次打碎。四川、湖南、广东等主要战场省份，由于各派军队的激烈争夺，甚至省内的统一也无法实现，首先进入了混战状态。在反对袁世凯称帝的大旗之下，革命派、立宪派、各地实力派暂时结成了政治联盟，但各派的政治理念和利益述求差别很大，矛盾冲突在护国运动过程中就不断出现。1916年6月6日袁世凯病逝，北洋军后撤，失去了共同的敌人，各派之间的矛盾冲突愈演愈烈，护国运动中并肩作战的战友很快变成了仇敌。
唐继尧作为地方实力派中的佼佼者，他不满足于统治云南一个省，早有称霸西南数省的野心，人口众多的四川首当其冲。在护国战争尚未结束的时候，蔡锷对于唐继尧的野心已经表露出不满，两人的矛盾逐渐加深。蔡锷在4月14日给殷承的电报中讽刺道：“蓂督增援计划已略更改，较前差胜一筹。此公近来颇喜武断，且好大务广，若过与争持，反有闹意见之嫌，且虞耽延时日，为害尤大。”蔡锷在6月4日给戴戡的电报中再次讽刺唐继尧：“蓂督通电滇编七军，以黄、叶、张、刘为四、五、六、七军总司令。古者天子六军，今能驾而上之，蓂公之魄力伟矣。”当时滇军第一军已经攻入四川，第二军攻入广东，云南并无战事，唐继尧在第三军之外又组建第四军、第五军、第六军、第七军，对外扩张的野心十分明显。
袁世凯死后，蔡锷认为国家的最大危险在于分裂，为维护国家统一，各地军队应该收缩，至少不应再扩大。他在7月19日给唐继尧的电报中很直率地批评：“所最宜注意者，我辈主张，应始终抱定为国家不为权利之初心，贯彻一致，不为外界所摇惑，不为左右私昵所劫持，实为公私两济。迩者滇省于袁氏倒毙之后，于刚出发之军，不惟不予撤回，反饬仍行前进，未出发者亦令克期出发，锷诚愚陋，实未解命意所在。近则已与川军启冲突于宁远矣。若竟徇某君等之一意孤行，必至败坏不可收拾，将何以善其后？锷为滇计，为蓂公计，不忍不告。”蔡锷的担忧后来不幸成为历史事实。梁启超对唐的野心也很不满，这种政治分歧导致他后来在关于护国运动的叙述中极力贬低唐继尧。
