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多基因风险评分 ≈ 基因占卜术,那就可"私人定制"婴儿?

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2018年《麻省理工科技评论》揭晓了2018年“全球十大突破性技术”,其中一项“Genetic Fortuna Telling”。

入选理由:大规模基因研究将让科学家能够预测普通疾病及人格特征。

技术突破:科学家们现在可以利用你的基因组数据预测你患各类疾病的几率,甚至你的智商也能被预测。

重大意义:基于 DNA 的预测技术可能公共健康领域下一个重大突破,但它将增加DNA歧视的风险、心理疾病负担风险。

“基因占卜术”

想像一下:将来有一天,婴儿从出生时就拿到一份属于自己DNA检测报告。这份报告将提供婴儿的各种患病几率、是否对烟草上瘾、哪些药物是否能吃、哪些营养需加强摄入、以及是否比一般人更聪明等等。大型基因研究(部分研究涉及人数超过 100 万人)的正在开展进行,这样的情景很快就会从概念变成生活,科学研究变现实应用。

多基因风险评分

科学研究证明,最常见的疾病如糖尿病、高血压、老年痴呆、癌症等等,还有人们的许多行为如智力水平、性格特征等等,都不是简单一个或几个基因影响的结果,而是许多个基因相互作用的结果。

由一个或简单的几个基因的突变引起的疾病有上千种,这类疾病的致病基因已经被鉴定出来,相对比较容易评估患病风险。

多基因风险评分(PRS)就是综合很多个易感基因位点信息预测疾病风险,在人群风险预测、优化筛查方案、实施精准预防等方面存在应用价值。

多基因风险评分

如何评估疾病风险

全基因组关联分析(Genome wide association study,GWAS)是对多个个体在全基因组范围的遗传变异(标记)多态性进行检测,获得基因型,进而将基因型与可观测的性状,即表型,进行群体水平的统计学分析,根据统计量或显著性 p 值筛选出最有可能影响该性状的遗传变异(标记),从而挖掘并寻找到与生物性状相关的基因,全面揭示疾病发生、发展与治疗相关的遗传基因。

通俗说就是,检测很多很多人的DNA ,发现每个人基因变异都不一样。然后群体水平的大样本统计分析出,哪些基因的哪些变异与人的性状如高矮胖瘦有关系,从而研究出哪些基因变异影响人的疾病,进而通过检测个体DNA预测疾病风险。

研究案例

第一个多基因检测实际上是 2017 年从 Myriad Genetics (MYGN)最先公布的,Myriad Genetics 是一家“个性化医疗”公司,专注于基因诊断,特别是癌症。这项名为 riskScore 的测试将 86 个 DNA 变异体与一个人的家庭和病史结合起来,以确定一个女性患乳腺癌的未来五年和终生风险。

日本横滨市立大学、T-CiRA联合项目、武田制药以及欧洲和美国等多家研究机构的联合团队于Nature Medicine期刊发表题为“Polygenic architecture informs potential vulnerability to drug-induced liver injury”的文章,报道了利用多基因风险评分预测药物性肝损伤(drug-induced liver injury,DILI)风险的最新研究成果。该多基因风险评分考虑了20,000多个基因变异。对于临床医生来说,可以基于此开展快速的基因检测以便在开药之前确定肝损伤风险较高的患者。检测结果可能会提示医生更改剂量,安排更频繁的后续检查以发现早期肝损伤的迹象,或完全更换药物。对于药物研究,该检测方案可以将高肝损伤风险的个体排除在临床试验之外,从而可以更准确地评估药物带来的受益。如果可以预测哪些人具有更高的风险,我们就能更放心地开出更多的用药处方。

美国消费级基因检测公司23andMe推出了一款颇具争议的糖尿病风险预测报告。该报告将基于“多基因风险评分”方法对客户罹患2型糖尿病的风险进行评估。该方法将一个人基因组中数千个位点的每个小风险进行累积,每个基因位点都可能带来很小的患病风险,但综合起来以某种特定的方式进行计算,患病风险就可能发生显著改变。

中国南京医科大学全球筛查研究项目,通过对19546中国非小细胞肺癌病例的样本和对照并做了一个27120个非小细胞肺癌患者和27355例非小细胞肺癌的全基因组相关研究的meta分析 (13327例病例和13328对照为中国血统;13793例和14027对照为欧洲血统)。发现了鉴定了6个新的易感基因位点与非小细胞肺癌的风险显着相关。使用19个GWAS衍生的风险位点产生了多基因风险评分,然后在一个独立的、大规模的前瞻性中国队列中,首次评估了它在预测肺癌风险方面的有效性。多基因风险评分成功地预测了中国研究人群中的肺癌病例。首次证明,基于GWAS的多基因风险评分可以有效地用于鉴别肺癌高危亚群,这些亚群可能会受益于基于PRS的肺癌筛查项目,从而在中国人群中进行精确预防。

该研究发现

  • 处于高遗传风险的轻度吸烟者(<30包/年)与处于中等遗传风险的重度吸烟者(>30包/年)显示出相当的风险。在每个遗传风险类别中,吸烟的程度与肺癌相对风险的增加相关。这就可以解释了一个段子“劝七八十岁老大爷不要抽烟的医生,结果挂得比老大爷还早所以必须不能抽烟,不然患病风险更大。
  • 处于低遗传风险的好处可能在很大程度上被吸烟所抵消,支持公共卫生努力不吸烟,强调每个人都有健康的无烟生活方式,为了自己,为了他人,为了孩子,即使对那些遗传风险较低的人也是如此。
  • 遗传得分在前20%,甚至是前10%的人,可以通过终生不吸烟来抵消他们患肺癌的大部分风险。

优点

精准个性化治疗上,科学家可以根据你对某些基因的敏感性来判断你需不需要使用这种药或者药物的剂量,还有判断未来能通过这种方法来预测个体的患病几率从而防病于未然。遗传学研究是精准医疗或个性化医疗的大趋势的一部分。

重要的是要记住,多基因风险评分只提供概率,而不是结论或诊断。仅仅因为你易患糖尿病甚至老年痴呆症,并不意味着你就会。显然还有其他因素与健康有关,主要是环境和生活方式。对于PRS显示高风险的群体而言,采取一级预防(建立起健康的生活方式,合理膳食、控制体重、规律运动、戒烟,药物控制,定期监测)措施,可以不同程度地降低患病风险。可以督促你改变生活方式和生活习惯,重视起来,健康起来,自律起来,运动起来,戒烟,戒酒。

缺点

从伦理道德上讲,对疾病预测,利用这些信息来选择出生,或选择更有可能在学业或运动上表现优异的婴儿,这将会是一个灾难。基于高多基因风险评分,保险公司是否能够拒绝承保预先存在的遗传疾病?

多基因风险评分提前是研究群体,所以必须考虑到群体差异性,不同的人中,其风险评估模型也不一样。一些提供多基因风险评分的公司大多将适用人群限制在欧洲血统人群中。例如,加州大学圣地亚哥分校科学家开发的一种阿尔茨海默症检测便只建议欧洲血统的人群使用。2017年,Myriad Genetics公司在其乳腺癌基因检测中也加入了多基因风险评分,用户也都是欧洲血统的女性。而在23andMe的一份声明中,该公司称其检测对于非洲裔、拉美裔美国人和亚洲人来说都是“准确的”。

心理负担,对疾病预测结果的恐慌,一种宿命论的感觉 ,反而影响心情,影响身体健康。

通过多基因评分

挑选更聪明健康的孩子

1978年,全球首例人类卵子体外受精(In vitro fertilization,IVF)婴儿出生,由于其受精过程在实验室进行,这些孩子被形象地称为“试管婴儿”。“试管婴儿”技术帮助许多人圆了当父母的梦想,至今四十多年时间里,全世界估计已有约700万例通过试管婴儿及其改良技术诞生的孩子。

近年来,随着技术的进步,开始出现了一项名为“基于多基因评分的胚胎选择(ESPC)”的服务,该技术可以允许接受体外受精者通过多基因评分选择更健康、更聪明的胚胎。

定制婴儿

目前已经有多家公司与进行试管婴儿辅助生殖的医疗机构合作,为那些进行试管婴儿的患者选择胚胎,希望挑选出成年后患糖尿病、癌症、心脏病、炎症性肠病、阿尔茨海默症和精神分裂症等疾病的概率更低的胚胎。

还有公司号称可以根据预测并挑选出将来受教育程度收入认知能力更高的胚胎。还有公司称将来可以提供对肤色智商的选择。

目前该技术很大程度上只适用于富裕人群,且预测最准确的是欧洲人,这会加剧社会的不公平。而且,被该技术放弃选择的特征,会被认为是一种价值较低的特征,进而带来偏见和歧视。例如,如果很多人都不选择白色皮肤,那么黑皮肤的人可能会因此被歧视。

总之,目前生物技术的飞速发展,挑战着目前现有的认知和伦理道德。曾经在试管婴儿也被当时伦理所批评,但如今人们已经欣然接受,并从中受益

您准备好迎接这个将会或已经出现“基因改造”人、“基因编辑”人的世界了吗?

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