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税务局一般会重点查询以下4个方面:
一、查交易
通过大数据，查询与你交易的下游企业的相关账本数据，比对是否存在异常；查询双方签订合同的具体内容，对比经营范围及需求，是否有异常。并查询交易上下游的账簿，核查同一笔交易入账的经济业务内容与价格是否一致。
二、查资金流
以结算方式为出发点，查询银行卡及现金的流向是否真实，有无资金流异常回流，以及双方的资金流是否一致。在面对发票问题时，一定保证发票、业务、资金三流一致，提供完整真实的证据链。
三、查成本费用
1、比对你开具出去的发票，收到的货款数额以及卖出的商品
2、差旅费、加油费、会议费等费用是否异常
3、通过成本和费用来比对你的利润是否为负数
4、核查企业库存账目以及进出货明细
5、通过比对同行业收入，稽查是否存在异常
四、查企业应纳税额
1、增值税收入是否长期大于企业所得税收入
2、税负率是否异常
3、税务局、银行等机构可以通过系统核实企业纳税信息及纳税人营业状态等情况
五、税务局税务检查一般是什么时候?
一般情况下是每年的5 -12月，如果系统判别你公司有问题，那么税务稽查组也是可能上门检查的。
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