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性骚扰风波后,著名学者David Sabatini发表的Nature文章被质疑

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化疗药物甲氨蝶呤语抑制二氢叶酸还原酶,该酶产生四氢叶酸,这是核苷酸合成中必不可少的辅助因子。四氢叶酸的消耗通过抑制 DNA 和 RNA 的产生导致细胞死亡。尽管甲氨蝶呤被广泛用作抗癌剂,并且是一千多项正在进行的临床试验的主题,但其高毒性往往导致其使用过早终止,从而降低其潜在疗效。

2018年7月11日,原怀特黑德研究所/霍华德休斯医学研究所/麻省理工学院David M. Sabatini团队在Nature 在线发表题为“Histidine catabolism is a major determinant of methotrexate sensitivity”的研究论文,该研究为了鉴定调节癌细胞对甲氨蝶呤反应的基因,进行了基于 CRISPR-Cas9 的筛选。该筛选产生了 FTCD,它编码一种酶——甲酰亚胺基转移酶环脱氨酶——这是氨基酸组氨酸分解代谢所必需的,该过程以前与甲氨蝶呤敏感性无关。在培养的癌细胞中,组氨酸降解途径中几个基因的消耗显著降低了对甲氨蝶呤的敏感性。从机制上讲,组氨酸分解代谢会排出细胞池中的四氢叶酸,这对甲氨蝶呤处理的细胞特别有害。此外,组氨酸分解代谢中限速酶的表达与癌细胞系中的甲氨蝶呤敏感性和患者的存活率有关。组氨酸的体内膳食补充剂增加了通过组氨酸降解途径的通量并增强了白血病异种移植物对甲氨蝶呤的敏感性。组氨酸降解途径显著影响癌细胞对甲氨蝶呤的敏感性,并可通过简单的饮食干预来提高甲氨蝶呤疗效。

2020年1月,该文章被质疑数据异常:图片涉嫌重复使用及原始数据出现大量重叠。2022年1月11日,该文章进行了纠正,作者表示这些错误并不会影响文章的结论。

由于David Sabatini深陷性骚扰风波,MIT怀特黑德生物医学研究所发布正式声明,宣布David Sabatini不再与怀特黑德研究所及霍华德休斯医学院存在任何关联。 应怀特黑德研究所的要求并确保通讯作者职责的履行,本作者更正的通讯作者现为 Naama Kanarek (naama.kanarek@childrens.harvard.edu),取代 David Sabatini。 所有作者同意作者更正和通讯作者的变更。

2018年7月11日,原怀特黑德研究所/霍华德休斯医学研究所/麻省理工学院David M. Sabatini团队在Nature 在线发表题为“Histidine catabolism is a major determinant of methotrexate sensitivity”的研究论文,该研究为了鉴定调节癌细胞对甲氨蝶呤反应的基因,进行了基于 CRISPR-Cas9 的筛选。该研究发现组氨酸降解途径显著影响癌细胞对甲氨蝶呤的敏感性,并可通过简单的饮食干预来提高甲氨蝶呤疗效。

但是,在2020年1月,该文章被质疑数据异常:图片涉嫌重复使用及原始数据出现大量重叠。

补充图 11 (a & b) 涉嫌图像重复使用

补充图 3涉嫌图片重复使用

原始数据涉嫌大量的重复

作者Naama Kanarek也在同一时间做了回复,允诺尽快在Nature 上进行更正。

2022年1月11日,该文章进行了纠正,声明指出:

在本文的图 1f 中,对照药物doxorubicin的三个生物学重复中的一个被另一个实验错误地重复。原始图 1f 显示在修正后的面板旁边,没有错误的复制,如本修正案的图 1。原始图 1 的源数据,其中包含有关此doxorubicin复制品的“存活 MTX”选项卡中的错误数据,也已更正,并显示为本修正案的补充信息。在图 1 图例中,文本“……与野生型细胞相比(n = 3,生物复制)”应为:'……与野生型细胞相比(n = 3,生物复制,除了doxorubicin Ramos细胞,其中 n = 2,”。

在本文的扩展数据图 11 中,“甲氨蝶呤”组中的两个组织切片(扩展数据图 11a 中的顶部和底部图像)和“vehicle”组中的两个切片(扩展数据中的中间和底部图像)图 11b)被复制,“组氨酸补充”(图 11b 中的底部图像)和“甲氨蝶呤”(扩展数据图 11b 中的顶部图像)组中的部分也被复制。扩展数据图 11 的原始面板显示在修正后的面板旁边,如本修正案的图 2。

在本文的补充图 3 中,复制了“甲氨蝶呤”组中的两个组织切片。原始和更正的补充图 3 显示为本修正案的补充图 1,新面板用红色轮廓标记。图 2 的源数据中存在错误,已更正,并在本修正案的补充信息中以红色突出显示;原始图2中的数据是正确的。在方法部分,用于筛选的 sgRNA 库的参考不正确。这些错误不影响论文的结论,原文章未在线更正。

由于David Sabatini 不再隶属于怀特黑德研究所或霍华德休斯医学研究所。应怀特黑德研究所的要求并确保通讯作者职责的履行,本作者更正的通讯作者现为 Naama Kanarek (naama.kanarek@childrens.harvard.edu),取代 David Sabatini。所有作者同意作者更正和通讯作者的变更。

参考消息:

https://www.nature.com/articles/s41586-018-0316-7

https://www.nature.com/articles/s41586-021-03487-2

https://pubpeer.com/publications/E9FDC02781F39940EA182E3D7B1120#18

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