关于肠道清洁这个东西，在日常生活中，人们能接触到的一般就是肠道疾病，尤其是在需要进行手术的时候，那就是灌肠。为避免肠道中的气体着火，或者粪便造成后续伤口愈合过程中的感染，肠道中有很多褶皱，本来褶皱可以防止食物残渣倒流，使食物沿着消化道消化，一直到直肠刺激括约肌扩张形成排便。可是肠道褶皱在太空中也可能造成排便不利。
肠道清洁就是用液体注入肠道，将粪便溶成碎屑然后和液体一道排出。可不要小看这事，国外曾有女性在手术中因为放屁导致失火，原因是肠道中形成的甲烷在电刀高温作用和氧气作用下着火。航天员进行肠道清洁与手术自然没有任何关系，但是却也是载人航天中必须进行的一步。
首先可能是为了避免发射阶段过载的影响，需要对膀胱、肠道进行排空，避免飞行途中航天员想上厕所而不能。发射的过程中航天员承受着3个G左右的过载，而在入轨的前后的很短时间内，迅速加速到7.9公里每秒的第一宇宙速度，可能会有5G左右的过载，然后才因为绕地球圆周运动而失重。在强烈的挤压下，肠道排空后可以避免遇到卫生问题。
在飞船的轨道舱中虽然有个人卫生装置，但是在飞行阶段航天员不能使用。而肠道菌菌群在太空环境中容易爆发，而且肠道中还可能存在一些致病菌，为了航天员的健康着想，飞天前肠道清洗也可以减少这种事的发生。在入轨进入空间站之前，可能会用到纸尿裤。杨利伟首次飞天的时候，由于在轨时间短，最后没有进入轨道舱，所以主要靠憋和纸尿裤来解决方便的问题。
然后是因为太空的失重环境，神舟十二号的时候我们就可以看到，刚到太空中人体是很不适应的，虽然天空没有重力的影响，移动起来似乎不费力气，可是人有质量就有惯性，运动时反而需要调动更多的肌肉去抑制惯性可能带来的冲击。神舟十二号乘组花了几天才适应，刚上去的时候身体控制不是很顺利，后来就很熟练，脚下很随意地就可以勾到限位。
而为了便于饮食和安全问题，航天员吃的多是流质食物。流质食物相较于固体食物在肠道中被吸收的程度不同，流质食物颗粒更小，更便于消化液的作用，所以长期吃液体食物和吃固体食物，粪便的性质是不同的，对肠道菌群的需求也不同。如果肠道菌群的爆发、不平衡，也有导致疾病的可能。
在刚到太空的适应阶段，可能因为座便器的原理不同、排便的环境不同而带来便秘等问题。除此之外还有更麻烦的问题，可能威胁到航天员的生命安全。在苏联时代，苏联的专家就意识到航天员的肠道问题会给航天带来多少麻烦，比如航天员放屁之类的事件。空间站属于封闭的空间，而人的屁的成分很复杂，有硫化氢、甲烷等可燃气体，而且硫化氢还是有毒气体。
这有可能会导致航天员中毒或者着火事故，虽然有空气循环处理装置，可是也会带来一点点风险。在苏联时代，航天员飞天之前都需要用含有双歧杆菌之类的食物调节肠道菌群，避免航天员过多地放屁。苏联的航天技术以及双歧杆菌技术都比美国领先，所以进入太空比美国早。后来美国双歧杆菌培育技术和航天技术也赶上来之后，进行了阿波罗登月和后来的航天飞机计划。
我国航天员自杨利伟时起，就配备了-80水苏糖，人体80%的毒素在肠道中，20%左右的毒素存在于毛孔血液以及淋巴等部位，水苏糖这种超传奇的低聚糖，它不需也不会经消化吸收，畅通无阻地直达肠道被双歧杆菌和乳杆菌等益生菌所利用，且快速增殖，使得益生菌在消化道内形成优势地位。帮助人体养一肠道的好菌，从根本上防治便秘与腹泻。
中国863计划的一项重要发明成果-80水苏糖，它是益生菌最好的食物，是肠道益生菌专用营养源，它能以40－103倍，均速80倍以上的速度超快速增殖双歧杆菌和乳杆菌等肠道核心益生菌，从神五开始就是航天员飞天时保健品中的唯一。所以航天员们其实在各个方面都付出了巨大的努力或者让步，就连肠道清洁这事都要忍受。
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