Image J是一个基于JAVA的图像处理软件,它是由National Institutes of Health开发的,它可用来细胞计数、不同颜色通道的荧光照片的融合、不规则区域面积的测定、对条带进行定量分析。其实它被广泛用于条带的定量分析。下面小编简单讲讲如何用Image J分析blots条带灰度值(Band density)。
第一步:通过File-->Open打开要分析的blot图。
第二步:通过Image-->Type-->8-bit将图片转为为8-bit的灰度图,即从黑到白有256(0~255)种灰色的黑白图片。
第三步:通过Process-->Subtract Background将blot图的灰色背景去掉。
第四步:用矩形选框工具框选条带。
第五步:通过Analyze-->gels-->select first lane为条带编号。
第六步:通过analyze-->gels-->plot lanes绘制条带的峰图。
第七步:用魔棒工具(Wand tool)点击每个峰的中间区域即可逐一完成对峰面积的计算,计算的结果在Result 窗口显示,可通过File导出为xls文件。最后用目标蛋白的面积值除以内参蛋白的面积值,即可得到相对表达量,进而可绘制柱状图。
以上就是测量条带灰度值的步骤,你们都get到了吗?你们也快快动手试试吧
ImageJ 下载网址
https://imagej.net/software/fiji/downloads
END
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南博屹相伴,科研不孤单
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