流行性传染病是随着人类社会的产生而存的，在中国古代的文献中，最早记载的流行性传染病是东周时期。在商周时期奉行“先鬼后礼”的神权制度，防治瘟疫靠巫术，随着文明的进步，中国古代认识流行性传染病的能力不断提升，防疫措施逐渐科学化。
西汉时期的《黄帝内经·素问·刺法论》提出防止传染需要“避其毒气”，即避免与患者接触，“隔离观察治疗”应运而生。
《汉书·平帝记》 记载了西汉末王莽掌权时就创建了中国史上最早的传染病隔离医院。
魏晋南北朝，防控流行性传染病的“隔离”成为制度。《晋书·王彪之传》记载了设立了专门的隔离机构——六疾馆，以隔离收治患病之人。
宋至清，阻止疫情传播的“隔离”措施更加“冷酷”，即便父子也不能接触。南宋初的笔记小说《猗觉寮杂记》中说：“江南病疫之家，往往至亲皆绝迹，不敢问疾，恐相染也。”
清代著名学者俞正燮史料笔记《癸巳存稿》中记载，为防止天花传播危及皇室，清初设有“查痘章京” 一职，查得天花病人即“令其迁出四、五十里以外”。顺治皇帝患天花而死，为确保年幼的康熙不被感染，太皇太后命保姆护视康熙于紫禁城外，不得进宫探望父皇……
除采取隔离措施外，古人也加强个人卫生管理。唐代《千金要方》有“常习不唾地”之说，李时珍《本草纲目》有“天行疫瘟，取初病人衣服，于甑上蒸过，则一家不染”之方，说明古人注重保持不随地吐痰和消毒防控等良好习惯。 预防传染病戴口罩的历史相对晚一些，《马可·波罗行记》中“元制规定，向大汗献食者，皆用绢巾蒙口鼻，以防唾沫污染食品”的记载，表明中国人元代便有使用口罩的习惯。在信息闭塞、医药匮乏的古代，隔离、戴口罩、勤洗澡、洗手、换衣等措施，对预防和阻止传染病发生、传播发挥了重要作用。
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