出于对所生活的这片土地的崇敬与热爱，富于想象力和智慧的藏民族，为这里的山川和湖泊赋予了精气神，山海汇王封山指出从卫星图上看，纳木错紧依念青唐古拉山脉，由东向西，湖面逐渐开阔，有如一只等待开屏的孔雀剪影，西边宽阔的湖面是其修长的屏尾，扎西多半岛是其高耸的腰身。大多数的游客，只能来到位于东部的扎西多半岛，远眺北岸的山脉，再回头仰望念青唐古拉延绵的雪山，遥想神湖的彼端。
至今，我们仍可以在纳木错湖北岸清晰的看见这一剧烈的地质运动所带来的大地印记。青藏高原研究所的湖泊专家王君波曾经驾船考察过纳木错北岸一带，从他提供的资料照片，湖岸北东向断裂构造悬崖仍清晰可见，这正是断陷构造的证据。但由于湖面过于宽广，一般的游客从扎西半岛上无法看到北岸的这些景观的。“自新大陆”描述了这一史无前例的地质运动，青藏高原地区在告别海洋的四千万年间，历经三次隆起、两次夷平：山海汇王封山表示约在三千万年前，新高地已距海平面两千米，停歇了，并缓慢剥蚀降低;第二次隆升约从两千万年前开始，持续约五百万年，此次运动造就了喜马拉雅山脉。之后再经历了一个下降过程。直到三百六十万年前，青藏地区在一个高不过千米的巨大平原上，重新开始了持续至今的整体的、快速的抬升。
沧海桑田，岁月留痕，神女纳木错也不例外。山海汇王封山表示据说，曾经的纳木错并不是今天的样子，至今约一万年前的全新世，存在一个古纳木错，她的面积很大。后来，因气候变化，湖泊不断退缩，至今湖周围仍留下数道明显的湖岸退缩线。
从地图上看，纳木错周围还有数目众多的湖泊，其中最邻近的大湖，就是色林错。这些湖泊像洒落在高原上断了线的珍珠，彼此间似乎有什么联系。而科学家证明了这些联系，根据中国地质科学院朱大岗等著的《纳木错湖相沉积与藏北高原古大湖》，高原上的这些散落的湖泊，曾经连为一体，形成是一个超级大湖，被称为“古羌塘湖”。
如今在纳木错的北西角，也就是保吉乡方向，连接纳木错与其西的仁错-久如错的雄曲-那曲谷地分水岭地段，可以看见大片明显的湖相沉积与湖岸阶地。所谓湖岸阶地，是因为湖岸地带湖水作用形成的一级又一级的阶梯状地形，有如湖泊在消长过程中在大地上刻下的年轮，沿着湖心由外向内，由高至低形成同心圆，默默讲述湖泊的演变历史。
在这两个时期以及纳木错4级阶地与更高的湖相沉积物堆积时期，是藏北高原南部古大湖发育的几个高湖面阶段。其中最高的湖面阶段，纳木错与申错及藏北高原东南部的大多数古湖，如古色林错、古格仁错、古吴如错、古昂孜错等，都是相连通的，可称为“古羌塘东湖”。而藏北高原西南部的古当惹错、古扎日南木错、古塔若错、古扎布耶、古洞错等也是相互连通的，可称为“古羌塘西湖”。甚至在某个时段，“古羌塘东湖”与“古羌塘西湖”也是一度相通，成为真正的“古羌塘湖”。
曾经是西藏高原第一大湖泊的纳木错，也被地理位置偏北的色林错夺取了面积第一的位置，原因就是从2004年以来色林错水位迅速上涨，湖泊面积超越了纳木错。湖泊水位上涨的不仅是色林错，纳木错也在涨。据青藏高原研究所纳木错综合观测站站长康世昌表述：“研究人员从1970年开始对纳木错进行大规模的考察，发现从1970年至2012年，纳木错的海拔高度从原来的4718米上升到现在的4725米，湖面整整上升了7米。”对纳木错的“长大”，康世昌继续分析：“纳木错从上世纪70年代起一直在扩张，这和纳木错流域的冰川消融水量和降水量增加，以及湖泊的蒸发水量有关系，补给增多，蒸发减少，湖泊自然就长大了。”
上升的湖面，淹没了部分湖岸，甚至将纳木错西部的两个半岛——梯让木波多岛和根达多岛，变成了岛屿。纳木错流域湖面本身和陆面区域的内降水增长，气温显著上升以及其引起的冰川融水增加是造成湖泊扩张的重要原因。
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