在医学临床上造血干细胞移植也被运用于骨髓增生异常综合征（MDS）的临床治疗指南上。在过去，对于年龄大于50岁的MDS患者一般都是不考虑骨髓移植的，主要原因是移植相关并发症的风险较高，但多年以来，现如今医学的进步，技术的提高，移植患者的年龄已放宽到60岁上下。
关于MDS年龄移植的问题，最好是低于60岁，但大约75%的MDS患者在确诊时超过60岁，所以站在年龄方面，常规的骨髓移植只适用于少数患者（年纪较大骨髓活跃度下降，对应恢复也更不利）
骨髓增生异常综合征“移植”成功率多少？
谈及移植成功率的问题，前提需要看MDS患者是否适合移植，如果现下移植是最符合最适合MDS最佳治疗方案的选择，那么对应的移植成功率也会相对提高。如果是被动，强行移植的情况下，那么成功率一般不会可观。
——出仓率高于百分八十，而移植成功率并非是出仓率，需整合临床治愈五年，完全康复十年的标准，目前数据还是比较缺乏的。对于长期生存率对比之前的一半不到，是有所提高的。
骨髓移植（也称为干细胞移植）可能会使MDS患者达到长期缓解状态。然而，骨髓移植涉及到使用高强度的化疗，有时会使用全身辐射，以消除骨髓中的所的分裂细胞。在某些情况下，治疗的风险可能会大于获得的益处。
近年来，没有亲缘的骨髓供者，用于技术的进步，可采用非亲缘的骨髓供者。在很大程度上，供者的外周血(外周血干细胞)已经取代骨髓作为干细胞的来源。
在临床上，高危的MDS一般会给出移植打算的建议，对于年龄低于60岁的患者，且有合适的同胞骨髓供者，可以考虑做两手准备。而对低危的、甚至是部分中危的MDS病友，不建议采用干细胞移植治疗作为一二线方案，风险可能大于治疗受益。
总而言之，造血干细胞移植是一项很好的治疗手段，病人家属在选择此项选择时需与主治考虑利弊问题，尽可能选择最优于患者病情的治疗手段。移植可作为“退路”治疗选择（因为同样存在高风险以及高敏阶段的复发可能性）。
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