在统计图像里面,小提琴图算是比较漂亮的一种图形了。
常见的小提琴图绘制方法包括 graphpad, R 语言,python 等,今天给大家介绍如何用 Origin 绘制小提琴图。
注明一点:Origin 在 2019b 的版本中才加入了小提琴图的绘制,而且除了传统的小提琴图之外,还加入了其他几种小提琴图的绘制选择,比如 violin with box, violin with point, violin with quantile, half violin 和 violin with stick 等。
1.1打开软件,导入数据,如果你的数据是 2 组以上,就在下图 book1 的空白处点击鼠标右键,然后选择 add new column,这样就生成了第三列 C 列。
1.2将事先准备好的数据复制到 book1. (long name = 长名称;units = 单位;comments = 注释)
1.3数据导入完成后,接下来就开始作图了:点击菜单栏的 plot 或右键数据选择 plot,在 statistical 选项内选择 violin plot,意为绘制普通的小提琴图。
1.4接下来对话框中,将 ABC 全部勾选,点击 ok
1.5草图绘制完成,左上角的 1 代表 origin 特有的图层,origin 可以多图层同时作图,以后会给大家进一步介绍。
2.1同 graphpad 作图一样,草图生成后相当于完成了一大半,剩下的就是修饰草图,包括填充色、线条、刻度等。
双击空白处,可以进行背景的设置,例如背景的颜色和边界的样式,如黑线和阴影等。
2.2双击小提琴,对 plot details 进行修饰,在 group 模块下,可以选择是 3 个小提琴一起同意修饰 (dependent) 还是各自独立修饰 (independent)。红色方块内容是需要修饰的内容,包括边界颜色、线条、盒体颜色、填充区域颜色等。
2.3我们选择 distribution fill 进行小提琴的颜色修饰,在 increment 下选择 by one,意为三个小提琴依次独立修改为…
2.4由于在统一修饰模式下,颜色是系统设定好的,所以有的同学可能觉的不够好看,那怎么办呢?别急,有办法:
先选择 independent 的 edit mode,然后双击其中一个小提琴进入 plot details 对话框
Independent 的原理就是一个一个地修饰,上图左侧红色方框中,勾掉另外两个后,在 distribution 模块下进行下图的选择。
2.5并同理对其他两个小提琴图逐一进行修饰,得到最终的小提琴图:
3.1同理类似于 graphpad,双击坐标轴后还可以对坐标轴的属性进行设置,如不需要调整,默认设计就好。
3.2上图中 Y 轴的 title 被我修改成了「生物学霸」哈哈,此外还可以在空白处点击右键,选择 add text 添加文本内容。让你的图变得更加完整。
4.1学会了做普通的小提琴图,其他各种形式的小提琴图也就信手拈来了。
4.2图片绘制完成后,点击菜单栏里的 file,选择 export,as image file,选择输出图片的格式,常见的为 tif 格式。
好啦,相信掌握了这篇文章的内容后,手握 graphpad 和 origin 两大利器,CNS 级别的小提琴图也就向你招手了。
本文图片均由作者提供
特别声明:以上内容(如有图片或视频亦包括在内)为自媒体平台“网易号”用户上传并发布,本平台仅提供信息存储服务。
Notice: The content above (including the pictures and videos if any) is uploaded and posted by a user of NetEase Hao, which is a social media platform and only provides information storage services.