归根结底还是航运密度、航运距离和成本的问题。经过马六甲海峡或者巽他海峡前往东北亚地区的货运船只，基本上以欧洲、中东和非洲为主，美洲地区或者大洋洲地区的货船基本上不走这里。而且在欧洲、中东和非洲的这些货船中，欧洲和中东占据七成，非洲三成。
以广州到科威特航线为例，如果走马六甲海峡，大体航路距离只有10307km（下图）；
如果走巽他海峡的话，航程就变成了11191km，前后两者之间多了800km，不要小看这800km，大多数远洋货轮航速不过14节左右，也就是25km/h，800km要多跑32个小时，成本当然高了。
如果广州到非洲坦桑尼亚，走马六甲海峡的话，距离大约要10449km；
如果此时该走巽他海峡，航程为10661km，两者相差很少。也就是说东非地区前往亚太的航运，走马六甲海峡或者巽他海峡都差不多。
如果广州前往西非尼日利亚，走马六甲海峡需要18308km；
如果该走巽他海峡的话，航程就可以缩短到17500km，节约800km。
所以，从上面的对比距离图就可以看出，前往中东、南亚、欧洲、北非还是要走马六甲海峡更好；前往东非，两个海峡都差不多；前往南非或者西非那就要走巽他海峡了。毕竟中东、欧洲要比西非、南非发达，货运量更大，因此就会出现走马六甲海峡的货船要多于走巽他海峡的。
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