天珠的分类有两种，天然天珠和人工天珠。
天然天珠有：圆板珠（又叫天眼石、羊眼天珠、羊眼板珠等）；药师珠（大部分为天然一线，但也有人工蚀刻的）；缠丝玛瑙（商业化别名众多）；法螺天珠（曾经喜马拉雅山地区是一片海洋，法螺天珠就是曾经水生物的化石，因为有圆圈，所以被视作神圣）；硅化木（部分树木在沙漠地区可玉化，很少一部分上有圆圈，取之打磨后可成配饰）；金钱石（密集恐惧症患者慎搜）。
人工天珠：在理论界称为“镶蚀玛瑙”、“镶蚀玉髓”、“蚀刻玛瑙”、“蚀刻玉髓”等等。由于先民并不清楚单晶质二氧化硅与多晶质二氧化硅的区别，所以在此并不区分玛瑙和玉髓的区别，下文统称玛瑙。
根据蚀刻材料来分类，可以分为碱蚀玛瑙浴酸洗玛瑙。酸洗一般使用硝酸，碱蚀一般使用植物碱。根据原产地划分。可以分为西藏天珠（通体蚀白后画黑线）、西亚天珠（红玉髓上蚀白线）、印度天珠（通体蚀黑后画白线，如龟背纹“寿珠”）、尼泊尔天珠（透明玛瑙上交替蚀刻黑白线）。根据网络学者划分，可以分为纯系、崩系、冲系。
归结来说，天珠应该是具有“眼睛崇拜”或是具有“圆圈类图腾”的先民挖到了天然、好看的石头，在信仰的作用下，先民大量佩戴，导致供不应求，然后就尝试人工蚀刻，至此，人工天珠就形成了。
最后强调一下镶蚀红玉髓。这类珠子的起源年份比西藏纯系天珠的年代要早，但是镶蚀技法一直没有失传，有西方考古学家还记录过制作过程，本来是属于巴比伦的首饰的（一说为巴比伦的货币），后来伊斯兰教产生，也很重视镶蚀红玉髓，目前北京古玩城仍有镶蚀着阿拉伯文的红玉髓。在佛教领域也有红玉髓是佛家七珍的说法（但也有学者认为“赤珠”并非红玉髓，而是南红玛瑙、红珊瑚、鱼耳石、蛇宝、竹米等多种观点）。
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