近年来，肥东县加大财政投入力度，加快推进城乡公交一体化进程，打破城乡二元结构，促进区域协调发展，逐步对农村客运进行公交化改造。肥东县于2007年启动城乡公交一体化改造工作，采取分片区、分步实施的方法，成熟一条改造一条。全县已完成县城、南部、东部地区和西部地区的店埠至白龙（草庙）城乡公交一体化改造工作，共收购私营农村客运班线车辆632台。下剩西部部分地区和北部地区204台农村客运班线车辆亟待改造。
2007年肥东县开通了店埠至合肥37至40路4条公交线路，淘汰326台微型面包车和30台中巴车，公交运力由开通时80台发展到现在122台。（包括店埠至合肥城区）
2010年开通了店埠至撮镇D199路公交线路，投入14台大型公交车。（包括店埠、撮镇）
2014年对县城地区客运公交化进行改造，开通了351至359路9条公交线路，投入105台公交运力，淘汰了原72台私人挂靠经营公交车，并将部分公交线路延伸至县城周边乡镇。（包括撮镇、牌坊乡、众兴乡）
2016年对南部、东部地区实施了城乡公交一体化改造，共开通14条公交线路。（包括店埠、撮镇镇、长临河镇、桥头集镇、合肥循环经济示范园、石塘镇、马湖乡、包公镇）
2017年共开通9条公交线路，其中：县城地区开通了T23路、538路2条公交线路。（县城）西部地区开通了店埠至草庙D207、店埠至白龙D106路2条公交线路；（草庙、白龙）南部、东部地区开通了D203等5条通村公交线路，并将县城区354路和店埠至马湖D105路公交车延伸至地铁2号线三十埠站，（马湖乡）352路公交车延伸至众兴乡永安村、357路延伸至众兴乡霞光村。（众兴乡）同时，周末开通长临河、马湖、白龙至圣泉中学3条公交专线，解决学生上下学出行难问题。
2018年下半年，肥东县计划收购下剩204台农村客运班线车辆，拟开通11条公交线路，全面完成城乡公交一体化改造工作。
肥东县的公交基础设施正在逐步完善，到今年年底前后，待5个客运换乘中心（店埠、石塘、长临河、梁园、白龙）项目建设完成后，将开通西北部地区11条公交线路，收购下剩204台农村客运班车，全面完成城乡公交一体化改造任务。此外，肥东县向省交通运输厅申报的“城乡道路客运一体化示范县”创建工作已通过专家评审入围，全县公共交通及其基础设施建设将会发生质的变化，群众出行将会更加方便快捷。
待肥东县西北部地区11条公交线路的全部开通，将结束西北部广大乡镇不通公交车的历史。
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