高昌国没有接受中原王朝的直接管辖，而是以独立王国形式存在的原因到底是什么？西域三十六国个个妄图争霸中亚，高昌国并入祖国利大于弊，有助于中华帝国势力深入中亚，哪怕弄个特别行政区的模样也好啊，还是那时中国的天子把高昌国视作域外之国（类似现在汉族为主体的新加坡），时间愈久，越容易被回鹘化（事实也是正是如此），与母国文化断层消亡。
除了王室自己的原因之外，也和高昌当地的豪族有关。了解高昌国的都应该知道，高昌的政治有两个特点：第一、高级官职都被王室及张氏家族垄断，中层官职则被其他豪族瓜分。第二、高昌是个只有几万人的小国，但是官职设置却是大国规模的，区区五六万人口的国家，居然设了一都、三郡、十四县、四镇。加上中央设有八个部等机构，官员估计有几百人之多。高昌一旦并入中原王朝，朝廷必然不会保留如此多的官职，必然大加裁减，剩下的官职主要也是流官。失去官位的高昌豪族去喝西北风啊？
备注：
高昌（维吾尔语：Qara-hoja），汉族在西域建立的佛教国家，位于今新疆吐鲁番东南之哈喇和卓（Karakhoja）地方，是古时西域交通枢纽。地当天山南路的北道沿线，为东西交通往来的要冲，亦为古代新疆政治、经济、文化的中心地之一。高昌历史文献，有《新唐书·高昌传》有比较详细的记载。公元5世纪中叶至7世纪中叶,在这个狭窄的吐鲁番盆地中，曾先后出现四个独立王国，分别是阚氏高昌、张氏高昌、马氏高昌及麴氏高昌，640年，唐朝灭麴氏高昌。安史之乱时高昌被回鹘侵占。
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